ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CDK9

Query protein: CDK9
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX5255099 | 293
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CDK9's Target genes

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◢ SRX5501661: A-375

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◢ SRX3408659: KELLY

◢ SRX3408661: KELLY

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◢ SRX327759: MM.1S

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◢ SRX2375366: MV-4-11

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◢ SRX148963: P493-6

◢ SRX148964: P493-6

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◢ SRX203391: Plasma Cells

◢ SRX4023329: T-47D

◢ SRX4023330: T-47D

◢ SRX728779: THP-1

◢ SRX728780: THP-1

◢ CDK9: STRING

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GAGE6 ↻ ≫
GAGE5 ↻ ≫
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CCDC200 ↻ ≫
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IFRD2 ↻ ≫
HYAL3 ↻ ≫
CALCOCO1 ↻ ≫
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TMOD4 ↻ ≫
SCNM1 ↻ ≫
LYSMD1 ↻ ≫
TMEM115 ↻ ≫
NPRL2 ↻ ≫
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GPBAR1 ↻ ≫
CALR3 ↻ ≫
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TESK2 ↻ ≫
MMACHC ↻ ≫
CCDC163 ↻ ≫
SMPD3 ↻ ≫
BOD1 ↻ ≫
CLPB ↻ ≫
FEM1A ↻ ≫
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HIKESHI ↻ ≫
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ST3GAL2 ↻ ≫
PNKD ↻ ≫
AAMP ↻ ≫
GSPT1 ↻ ≫
AP2S1 ↻ ≫
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SLC39A1 ↻ ≫
CREB3L4 ↻ ≫
CHMP4B ↻ ≫
CRTC2 ↻ ≫
TSNAXIP1 ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
RANBP10 ↻ ≫
BTRC ↻ ≫
TMTC3 ↻ ≫
CEP290 ↻ ≫
PPRC1 ↻ ≫
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PANK4 ↻ ≫
HES5 ↻ ≫
PEMT ↻ ≫
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RPL36 ↻ ≫
MICOS13 ↻ ≫
HSD11B1L ↻ ≫
DDX23 ↻ ≫
PRCC ↻ ≫
KBTBD7 ↻ ≫
UNK ↻ ≫
H3-3B ↻ ≫
PPP1R12C ↻ ≫
C1orf159 ↻ ≫
LARS1 ↻ ≫
UBE2T ↻ ≫
PPP1R12B ↻ ≫
INVS ↻ ≫
ERP44 ↻ ≫
CTU1 ↻ ≫
PHF12 ↻ ≫
ZNF225 ↻ ≫
ZFYVE1 ↻ ≫
VARS2 ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
VCPIP1 ↻ ≫
C8orf44-SGK3 ↻ ≫
RASSF1 ↻ ≫
TSSC4 ↻ ≫
ZMYND10 ↻ ≫
MAD2L1BP ↻ ≫
GTPBP2 ↻ ≫
NTAN1 ↻ ≫
CHPF2 ↻ ≫
ABCF2 ↻ ≫
BANP ↻ ≫
SYMPK ↻ ≫
FOXA3 ↻ ≫
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IFT20 ↻ ≫
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GFUS ↻ ≫
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RRAS ↻ ≫
DSTYK ↻ ≫
UBQLN4 ↻ ≫
LAMTOR2 ↻ ≫
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ZNF513 ↻ ≫
SNX17 ↻ ≫
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INTS9 ↻ ≫
HMBOX1 ↻ ≫
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WDPCP ↻ ≫
MDH1 ↻ ≫
ASIC3 ↻ ≫
TTC13 ↻ ≫
ING3 ↻ ≫
STK25 ↻ ≫
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CDK5 ↻ ≫
CCDC146 ↻ ≫
SUFU ↻ ≫
ACTR1A ↻ ≫
TTC33 ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
ZFYVE28 ↻ ≫
CFAP99 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
UNKL ↻ ≫
CCP110 ↻ ≫
GATB ↻ ≫
C16orf91 ↻ ≫
TIMM21 ↻ ≫
FBXO15 ↻ ≫
TLE3 ↻ ≫
EMILIN1 ↻ ≫
SV2A ↻ ≫
ZNF749 ↻ ≫
KHK ↻ ≫
OST4 ↻ ≫
WNK1 ↻ ≫
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MED15 ↻ ≫
NOP14 ↻ ≫
GRK4 ↻ ≫
BOLA1 ↻ ≫
JOSD2 ↻ ≫
ASPDH ↻ ≫
AP2M1 ↻ ≫
UBR2 ↻ ≫
ZFYVE19 ↻ ≫
DNAJC17 ↻ ≫
DEXI ↻ ≫
CLEC16A ↻ ≫
TMEM127 ↻ ≫
CIAO1 ↻ ≫
ZNF337 ↻ ≫
TMEM59 ↻ ≫
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MAF1 ↻ ≫
CYC1 ↻ ≫
WDR87 ↻ ≫
SIPA1L3 ↻ ≫
TSC2 ↻ ≫
NTHL1 ↻ ≫
WDR97 ↻ ≫
TFEB ↻ ≫
ZNF56 ↻ ≫
MIDN ↻ ≫
ATP5F1D ↻ ≫
PEX14 ↻ ≫
SIRT2 ↻ ≫
NFKBIB ↻ ≫
RPS7 ↻ ≫
PHF13 ↻ ≫
MRI1 ↻ ≫
C19orf53 ↻ ≫
CTF1 ↻ ≫
BCL7C ↻ ≫
TRAPPC3 ↻ ≫
MAP7D1 ↻ ≫
TOR1AIP2 ↻ ≫
TOR1AIP1 ↻ ≫
UBAC1 ↻ ≫
DFFA ↻ ≫
SMARCAL1 ↻ ≫
BUB1B ↻ ≫
DESI2 ↻ ≫
KMT2B ↻ ≫
CBARP ↻ ≫
RIC8B ↻ ≫
NUF2 ↻ ≫
VPS50 ↻ ≫
HEPACAM2 ↻ ≫
TMEM70 ↻ ≫
ELOC ↻ ≫
RPS2 ↻ ≫
RNF151 ↻ ≫
FBXW11 ↻ ≫
NMT1 ↻ ≫
DCAKD ↻ ≫
ZNF517 ↻ ≫
ZNF34 ↻ ≫
RPL8 ↻ ≫
ZNF189 ↻ ≫
MRPL50 ↻ ≫
TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
FBXO46 ↻ ≫
ING4 ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
IPPK ↻ ≫
TMEM208 ↻ ≫
LRRC29 ↻ ≫
RPGRIP1L ↻ ≫
FTO ↻ ≫
CCDC90B ↻ ≫
SESN1 ↻ ≫
EAPP ↻ ≫
DYNC1I2 ↻ ≫
BUB3 ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
MEIOSIN ↻ ≫
PERCC1 ↻ ≫
HMX2 ↻ ≫
PSMD11 ↻ ≫
RPS20 ↻ ≫
EMP3 ↻ ≫
CCDC114 ↻ ≫
RANGAP1 ↻ ≫
ZNF235 ↻ ≫
SOX6 ↻ ≫
C11orf58 ↻ ≫
USP48 ↻ ≫
NDUFS2 ↻ ≫
ADAMTS4 ↻ ≫
RAB5C ↻ ≫
RAB1A ↻ ≫
PRRG2 ↻ ≫
NOSIP ↻ ≫
SLC25A19 ↻ ≫
CAPN15 ↻ ≫
ATP5PO ↻ ≫
THRAP3 ↻ ≫
LETM1 ↻ ≫
DCP1A ↻ ≫
THYN1 ↻ ≫
ACAD8 ↻ ≫
TMEM160 ↻ ≫
FBXL19 ↻ ≫
CNIH4 ↻ ≫
ZNF169 ↻ ≫
TRAF7 ↻ ≫
RAB26 ↻ ≫
LMNB2 ↻ ≫
ZNF420 ↻ ≫
NUDT13 ↻ ≫
PDE6D ↻ ≫
COPS7B ↻ ≫
OSCAR ↻ ≫
NDUFA3 ↻ ≫
PEX26 ↻ ≫
CCDC150 ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
FBXO48 ↻ ≫
APLF ↻ ≫
CLP1 ↻ ≫
CCAR2 ↻ ≫
C8orf58 ↻ ≫
ZNF224 ↻ ≫
B3GALNT2 ↻ ≫
TRAK2 ↻ ≫
STRADB ↻ ≫
RALBP1 ↻ ≫
VIPAS39 ↻ ≫
AHSA1 ↻ ≫
YPEL4 ↻ ≫
CHCHD3 ↻ ≫
RPL18A ↻ ≫
LY6G5B ↻ ≫
GPANK1 ↻ ≫
CSNK2B ↻ ≫
C6orf47 ↻ ≫
APOM ↻ ≫
ZC3H11A ↻ ≫
ZBED6 ↻ ≫
MARS1 ↻ ≫
ARHGAP9 ↻ ≫
PTDSS2 ↻ ≫
ANO9 ↻ ≫
RBL1 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
STX5 ↻ ≫
SNX27 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
ENPP3 ↻ ≫
ZNF140 ↻ ≫
TTBK1 ↻ ≫
MON1A ↻ ≫
NOXO1 ↻ ≫
ZNF354A ↻ ≫
DDX49 ↻ ≫
COPE ↻ ≫
ZNF350 ↻ ≫
STK17A ↻ ≫
ZNF554 ↻ ≫
KAT7 ↻ ≫
MYLK4 ↻ ≫
RABAC1 ↻ ≫
NME1-NME2 ↻ ≫
NME1 ↻ ≫
GPR15 ↻ ≫
CLDND1 ↻ ≫
WBP1 ↻ ≫
INO80B ↻ ≫
ZNF384 ↻ ≫
FAM193A ↻ ≫
RBM6 ↻ ≫
TMEM102 ↻ ≫
FGF11 ↻ ≫
CHRNB1 ↻ ≫
PANK3 ↻ ≫
TMEM43 ↻ ≫
CHCHD4 ↻ ≫
CTDP1 ↻ ≫
FAM185A ↻ ≫
PA2G4 ↻ ≫
SPEM3 ↻ ≫
BIRC5 ↻ ≫
SMUG1 ↻ ≫
UFSP2 ↻ ≫
C4orf47 ↻ ≫
GPKOW ↻ ≫
CCDC174 ↻ ≫
NFXL1 ↻ ≫
SERPINI1 ↻ ≫
PDCD10 ↻ ≫
CDK5RAP2 ↻ ≫
HTRA2 ↻ ≫
DQX1 ↻ ≫
YPEL3 ↻ ≫
TBX6 ↻ ≫
SCAMP4 ↻ ≫
ADAT3 ↻ ≫
UBE2Q1 ↻ ≫
CHRNB2 ↻ ≫
SF3A3 ↻ ≫
UTP11 ↻ ≫
FHL3 ↻ ≫
WRNIP1 ↻ ≫
RPS6KB2 ↻ ≫
UCHL5 ↻ ≫
RO60 ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
ZNF230 ↻ ≫
SDCCAG8 ↻ ≫
CEP170 ↻ ≫
NUP153 ↻ ≫
ZNF37A ↻ ≫
LTA4H ↻ ≫
PTPRCAP ↻ ≫
FAM222A ↻ ≫
CNOT4 ↻ ≫
ZW10 ↻ ≫
CLDN25 ↻ ≫
BICD2 ↻ ≫
PNPLA6 ↻ ≫
SPEM2 ↻ ≫
AKIRIN2 ↻ ≫
GPAA1 ↻ ≫
EXOSC4 ↻ ≫
FAM228B ↻ ≫
CALR ↻ ≫
CNOT1 ↻ ≫
ZNF133 ↻ ≫
TMEM245 ↻ ≫
UTP3 ↻ ≫
RPS19 ↻ ≫
POLR2E ↻ ≫
UBL7 ↻ ≫
ZNF227 ↻ ≫
PRR22 ↻ ≫
DUS3L ↻ ≫
ZNF527 ↻ ≫
HBP1 ↻ ≫
SLMAP ↻ ≫
GPX4 ↻ ≫
RPS3 ↻ ≫
RTN2 ↻ ≫
GABARAP ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
SLC33A1 ↻ ≫
LIN37 ↻ ≫
INTS1 ↻ ≫
WBP2 ↻ ≫
PROSER3 ↻ ≫
HSPB6 ↻ ≫
PHF23 ↻ ≫
DVL2 ↻ ≫
MRPL20 ↻ ≫
CCNL2 ↻ ≫
PKLR ↻ ≫
FDPS ↻ ≫
SAMD1 ↻ ≫
MISP3 ↻ ≫
C19orf67 ↻ ≫
ZNF226 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
SNRPE ↻ ≫
SNX1 ↻ ≫
CIAO2A ↻ ≫
PIGU ↻ ≫
NKIRAS1 ↻ ≫
SPHK2 ↻ ≫
RPL18 ↻ ≫
FAM83E ↻ ≫
PCM1 ↻ ≫
SYPL1 ↻ ≫
PSENEN ↻ ≫
RALGAPA2 ↻ ≫
NEK8 ↻ ≫
HSPA13 ↻ ≫
MXI1 ↻ ≫
ZGPAT ↻ ≫
ARFRP1 ↻ ≫
LAMP1 ↻ ≫
RPS26 ↻ ≫
NFKBIL1 ↻ ≫
DDX39B ↻ ≫
ATP6V1G2 ↻ ≫
RPS13 ↻ ≫
NOP53 ↻ ≫
SLC27A5 ↻ ≫
PGBD4 ↻ ≫
EMC7 ↻ ≫
SEC61A1 ↻ ≫
PRR5L ↻ ≫
TP53I3 ↻ ≫
SF3B6 ↻ ≫
PHB2 ↻ ≫
CDCA8 ↻ ≫
C1orf109 ↻ ≫
TIMM13 ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
LUC7L ↻ ≫
FAM234A ↻ ≫
TAF12 ↻ ≫
ZNF514 ↻ ≫
ZNF2 ↻ ≫
SLX1B ↻ ≫
SLX1A ↻ ≫
BOLA2B ↻ ≫
BOLA2 ↻ ≫
SCRT1 ↻ ≫
DGAT1 ↻ ≫
S1PR4 ↻ ≫
ZNF484 ↻ ≫
PTBP1 ↻ ≫
SYNGR4 ↻ ≫
PIH1D1 ↻ ≫
ALDH16A1 ↻ ≫
QTRT2 ↻ ≫
CCDC191 ↻ ≫
LRFN3 ↻ ≫
CFAP410 ↻ ≫
NCLN ↻ ≫
METTL26 ↻ ≫
WFIKKN1 ↻ ≫
ZNF32 ↻ ≫
PRR14 ↻ ≫
FBRS ↻ ≫
WDR53 ↻ ≫
FBXO45 ↻ ≫
ZNF547 ↻ ≫
TRAPPC2B ↻ ≫
AHCTF1 ↻ ≫
MTMR9 ↻ ≫
SPATC1L ↻ ≫
RPP40 ↻ ≫
CLDN6 ↻ ≫
PSMD4 ↻ ≫
TXNDC9 ↻ ≫
EIF5B ↻ ≫
UBALD1 ↻ ≫
MGRN1 ↻ ≫
RPL15 ↻ ≫
ZNF419 ↻ ≫
SEC11C ↻ ≫
TPGS1 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
FAM180B ↻ ≫
GALK2 ↻ ≫
TNFRSF12A ↻ ≫
THOC6 ↻ ≫
HCFC1R1 ↻ ≫
ZNF500 ↻ ≫
ZNF772 ↻ ≫
HEXIM2 ↻ ≫
MED27 ↻ ≫
RPL29 ↻ ≫
TTC1 ↻ ≫
AQR ↻ ≫
CIC ↻ ≫
CAND1 ↻ ≫
ZCCHC8 ↻ ≫
TMEM69 ↻ ≫
GPBP1L1 ↻ ≫
CWC22 ↻ ≫
PEX12 ↻ ≫
AP2B1 ↻ ≫
ENOX2 ↻ ≫
RAB29 ↻ ≫
SLC17A7 ↻ ≫
PES1 ↻ ≫
FAM207A ↻ ≫
SULT1A4 ↻ ≫
SULT1A3 ↻ ≫
DNM1L ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
RNASEH2C ↻ ≫
KAT5 ↻ ≫
ASXL1 ↻ ≫
RPL23A ↻ ≫
ZNF343 ↻ ≫
RAB34 ↻ ≫
PROCA1 ↻ ≫
ZNF26 ↻ ≫
TLCD1 ↻ ≫
TMEM186 ↻ ≫
PMM2 ↻ ≫
RPL37 ↻ ≫
CARD6 ↻ ≫
GINS3 ↻ ≫
GSK3A ↻ ≫
CDK8 ↻ ≫
ZMYND15 ↻ ≫
MED11 ↻ ≫
CXCL16 ↻ ≫
TERF2 ↻ ≫
WAPL ↻ ≫
FARSA ↻ ≫
FAM166A ↻ ≫
DBP ↻ ≫
OPA1 ↻ ≫
RCAN1 ↻ ≫
USP35 ↻ ≫
KCTD21 ↻ ≫
ZBTB7A ↻ ≫
IGSF8 ↻ ≫
MAX ↻ ≫
ZNF451 ↻ ≫
RAB30 ↻ ≫
PSMD2 ↻ ≫
COPS7A ↻ ≫
PPP6C ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
TMED9 ↻ ≫
B4GALT7 ↻ ≫
CA11 ↻ ≫
TSACC ↻ ≫
CCT3 ↻ ≫
NCBP2AS2 ↻ ≫
NCBP2 ↻ ≫
CAPG ↻ ≫
RAB13 ↻ ≫
CWC25 ↻ ≫
STPG3 ↻ ≫
UBE2J2 ↻ ≫
PSMC4 ↻ ≫
GID4 ↻ ≫
ATPAF2 ↻ ≫
DDX47 ↻ ≫
NOLC1 ↻ ≫
GPR108 ↻ ≫
FAM53C ↻ ≫
CDC25C ↻ ≫
LSG1 ↻ ≫
EIF1B ↻ ≫
ZMAT5 ↻ ≫
UQCR10 ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
SSR3 ↻ ≫
PCLAF ↻ ≫
UBA52 ↻ ≫
ILF3 ↻ ≫
ALG10B ↻ ≫
BOLA2-SMG1P6 ↻ ≫
ZNF768 ↻ ≫
ZNF747 ↻ ≫
TMEM262 ↻ ≫
SSR2 ↻ ≫
BOD1L1 ↻ ≫
MUS81 ↻ ≫
CFL1 ↻ ≫
VAPA ↻ ≫
RBBP5 ↻ ≫
RPS27 ↻ ≫
METTL3 ↻ ≫
SLC38A9 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
H3C15 ↻ ≫
H3C14 ↻ ≫
H2AC19 ↻ ≫
H2AC18 ↻ ≫
PSMF1 ↻ ≫
EML6 ↻ ≫
SCAMP3 ↻ ≫
FAM189B ↻ ≫
HPS6 ↻ ≫
ARMH3 ↻ ≫
THAP11 ↻ ≫
RPS3A ↻ ≫
ZSCAN32 ↻ ≫
ZNF174 ↻ ≫
L3MBTL2 ↻ ≫
ADSS2 ↻ ≫
DOHH ↻ ≫
COPS2 ↻ ≫
KBTBD8 ↻ ≫
TMEM222 ↻ ≫
USP31 ↻ ≫
KANSL1 ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
TRIP10 ↻ ≫
THAP1 ↻ ≫
SHC1 ↻ ≫
LEMD2 ↻ ≫
PARL ↻ ≫
CATSPERE ↻ ≫
WASF1 ↻ ≫
CDC40 ↻ ≫
TMEM199 ↻ ≫
SEBOX ↻ ≫
POLDIP2 ↻ ≫
SUGP1 ↻ ≫
MAU2 ↻ ≫
GPR137 ↻ ≫
HIRIP3 ↻ ≫
EXOC4 ↻ ≫
ZNF789 ↻ ≫
ATP5MF-PTCD1 ↻ ≫
ATP5MF ↻ ≫
ABRAXAS2 ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
ZNF805 ↻ ≫
AURKC ↻ ≫
FHIT ↻ ≫
RPL27 ↻ ≫
IFI35 ↻ ≫
CLPP ↻ ≫
MBD1 ↻ ≫
CXXC1 ↻ ≫
PRKCI ↻ ≫
MTR ↻ ≫
EEF1AKMT2 ↻ ≫
GFM1 ↻ ≫
ZNF862 ↻ ≫
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PTPN6 ↻ ≫
C12orf57 ↻ ≫
ZNF567 ↻ ≫
AKAP8 ↻ ≫
PSMD3 ↻ ≫
MEN1 ↻ ≫
MAP4K2 ↻ ≫
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CCND3 ↻ ≫
NCDN ↻ ≫
KIAA0319L ↻ ≫
RETSAT ↻ ≫
CARS1 ↻ ≫
AMD1 ↻ ≫
TSN ↻ ≫
DPP9 ↻ ≫
NUTF2 ↻ ≫
CENPT ↻ ≫
ZNF25 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
ZNF773 ↻ ≫
PPP1R13L ↻ ≫
POLR1G ↻ ≫
ZSWIM9 ↻ ≫
LIG1 ↻ ≫
SASS6 ↻ ≫
GSTA4 ↻ ≫
ZNF584 ↻ ≫
ZNF586 ↻ ≫
C12orf43 ↻ ≫
SLC50A1 ↻ ≫
MRPS16 ↻ ≫
DNAJC9 ↻ ≫
CSRNP2 ↻ ≫
ZNF277 ↻ ≫
DOCK4 ↻ ≫
NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
RGL2 ↻ ≫
PFDN6 ↻ ≫
RRP15 ↻ ≫
RPL22 ↻ ≫
RNF207 ↻ ≫
RACGAP1 ↻ ≫
LAT ↻ ≫
SKP2 ↻ ≫
LMBRD2 ↻ ≫
ESCO2 ↻ ≫
TOR1A ↻ ≫
EIF3C ↻ ≫
XPOT ↻ ≫
PRKCSH ↻ ≫
CCDC151 ↻ ≫
VMO1 ↻ ≫
PSMB6 ↻ ≫
POLRMT ↻ ≫
GLTPD2 ↻ ≫
FGF22 ↻ ≫
ALG10 ↻ ≫
VKORC1 ↻ ≫
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TUT1 ↻ ≫
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SMN1 ↻ ≫
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STMN3 ↻ ≫
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CRK ↻ ≫
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WIZ ↻ ≫
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