| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 線虫の変異株データ | WorTS | 10.18908/lsdba.nbdc01139-001 |
線虫の胚発生致死温度感受性変異株のデータ。 変異株毎に、遺伝子名等の一般的な情報、及び変異情報、表現型の情報等を格納している。エントリー数150。 CSV形式のテキストファイル。 |
worts.zip
(5KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/worm_ts_mutant_database |
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150件 |
データ詳細
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| 薬膳レシピデータ | YAKUZEN | 10.18908/lsdba.nbdc01605-001 |
食材が持つ効能 (性味,帰経など) と薬膳レシピのデータベースです。 |
yakuzen.zip
(213 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/yakuzen |
文献から抽出 |
1,539 件 |
データ詳細
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| Yeast Interacting Proteins DatabaseのCoreデータ(アノテーション更新版） | Yeast Interacting Proteins Database | 10.18908/lsdba.nbdc00742-001 |
Yeast Interacting Proteins Databaseにおいて、「IST hit」(下表で説明）が3以上の再現性の高い相互作用のデータ。 アノテーション（gene nameとdescription）をSGD（Saccharomyces Genome Database；http://www.yeastgenome.org/、 2009/8/15）によって更新している。 データ件数は841件。 CSV形式のテキストファイル。 |
core_updated.zip
(77KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/yipd_core_updated |
酵母２ハイブリッド法（Fields, S. & Song, O. K. (1989) Nature (London) 340, 245-246.） |
実験によって取得された相互作用の信頼度の指標として、酵母蛋白質とその相互作用についての文献情報等を、 YPD（Yeast Proteome Database, Costanzo, M. C., Hogan, J. D., Cusick, M. E., Davis, B. P., Fancher, A. M., Hodges, P. E., Kondu, P., Lengieza, C., Lew-Smith, J. E., Lingner, C., et al. (2000) Nucleic Acids Res. 28, 73-76.）等から収集し記載している。 |
841件 |
データ詳細
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| Yeast Interacting Proteins DatabaseのCoreデータ(オリジナル版） | Yeast Interacting Proteins Database | 10.18908/lsdba.nbdc00742-003 |
Yeast Interacting Proteins Databaseにおいて、「IST hit」(下表で説明）が3以上の再現性の高い相互作用のデータ。 遺伝子情報（gene name, description)は論文(*1)発 表時のデータ。 データ件数は841件。 CSV形式のテキストファイル。 |
core_original.zip
(37KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/yipd_core |
酵母２ハイブリッド法（Fields, S. & Song, O. K. (1989) Nature (London) 340, 245-246.） |
実験によって取得された相互作用の信頼度の指標として、酵母蛋白質とその相互作用についての文献情報等を、 YPD（Yeast Proteome Database, Costanzo, M. C., Hogan, J. D., Cusick, M. E., Davis, B. P., Fancher, A. M., Hodges, P. E., Kondu, P., Lengieza, C., Lew-Smith, J. E., Lingner, C., et al. (2000) Nucleic Acids Res. 28, 73-76.）等から収集し記載している。 |
841件 |
データ詳細
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| Yeast Interacting Proteins DatabaseのFullデータ(アノテーション更新版） | Yeast Interacting Proteins Database | 10.18908/lsdba.nbdc00742-002 |
Yeast Interacting Proteins Databaseにおける全データ。 アノテーション（gene nameとdescription）をSGD（Saccharomyces Genome Database；http://www.yeastgenome.org/、 2009/8/15）によって更新している。 データ件数は4,549件。 CSV形式のテキストファイル。 |
full_updated.zip
(372KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/yipd_full_updated |
酵母２ハイブリッド法（Fields, S. & Song, O. K. (1989) Nature (London) 340, 245-246.） |
実験によって取得された相互作用の信頼度の指標として、酵母蛋白質とその相互作用についての文献情報等を、 YPD（Yeast Proteome Database, Costanzo, M. C., Hogan, J. D., Cusick, M. E., Davis, B. P., Fancher, A. M., Hodges, P. E., Kondu, P., Lengieza, C., Lew-Smith, J. E., Lingner, C., et al. (2000) Nucleic Acids Res. 28, 73-76.）等から収集し記載している。 |
4,549件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |
データのメタデータ一覧