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データのメタデータ一覧
全 696 件 (641件から645件)
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データ名 データベース名 DOI 説明 データファイル 簡易検索URL データ取得方法 解析方法 データ件数 データ詳細
カテゴリ Webリソースポータルサイト 10.18908/lsdba.nbdc01091-001

解析ツールやワークフローを、「処理要素別」「(研究)分野別」「文献別」の3種類のカテゴリに分類したもの。(「データタイプ別」は未整備。)
「処理要素別」分類では、「比較する」「分類する」「探索する」「同定/予測する」「ルールを発見する」など、解析ツールの 処理概念をもとに分類している。
「分野別」分類では、ワークフローを「ゲノム解析」「発現制御解析」「進化系統解析」など研究分野別に分類している。
「文献別」分類では、文献から読み取った「シロイヌナズナゲノム解読(遺伝子領域予測)」などのワークフローを文献別に分類している。
データファイルは、カテゴリの構造をXMLファイル形式で表現したものになっている。

web_resource_portal_category.zip
(51.3 KB)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/web_resource_portal_category

3007 ノード (Rootノードを含む)
データ詳細 open_in_full
ツール Webリソースポータルサイト 10.18908/lsdba.nbdc01091-002

分子生物学に関わる解析ツールの一覧。各ツールの説明や文献へのリンクなどの情報を提供している。

web_resource_portal_tool.zip
(47.8 KB)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/web_resource_portal_tool

462 件
データ詳細 open_in_full
ワークフロー Webリソースポータルサイト 10.18908/lsdba.nbdc01091-003

Nature誌で発表されたゲノム解読の文献から、解析ツールを使ったゲノム解読のワークフローを表やグラフにまとめたもの。

web_resource_portal_workflow.zip
(16.8 KB)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/web_resource_portal_workflow

18 件
データ詳細 open_in_full
WINGpro記事 WINGpro 10.18908/lsdba.nbdc00737-002

データベースごとにデータベースのURL、提供機関、生物種などの詳細情報を記載したwikiの記事。本アーカイブでは一部を除いて公開している。

wingpro_wiki.zip
(38KB)
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個別データベースサイトから公開されている情報をもとに作成。アカウントを作成しメール認証を経ることで、ユーザーも記事の投稿や編集が可能。

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417件
データ詳細 open_in_full
データベース一覧 WINGpro 10.18908/lsdba.nbdc00737-001

WINGproに掲載されているデータベースの一覧。データベースのURL、生物種、説明などの基本情報がリストされている。

wingpro_list.zip
(29KB)
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個別データベースサイトから公開されている情報をもとに作成。

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419件
データ詳細 open_in_full
データ名 データベース名 DOI 説明 データファイル 簡易検索URL データ取得方法 解析方法 データ件数 データ詳細