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生命科学系データベースアーカイブ

「科学技術用語形態素解析辞書」(バイオサイエンスデータベースセンター)を追加しました

「科学技術用語形態素解析辞書」は、JSTシソーラスの見出し語と同義語を、形態素解析エンジンMeCabのユーザー辞書として使える形にしたものです。

「NBDC NikkajiRDF」 (国立研究開発法人 科学技術振興機構)のデータを更新しました

「NBDC NikkajiRDF」は日本化学物質辞書(日化辞)のデータを化合物情報のRDF記述で標準となっているオントロジーを用いてRDF化したデータベースです。
今回の更新では、以下のデータを更新しました。

「HHDB」(国立研究開発法人 量子科学技術研究開発機構)を更新しました

「HHDB」は中性子回折法や高分解能X線回折法による生体高分子の立体構造中の、水素や水和水、水素結合のデータベースです。 今回の更新では、「分子情報」および「水素結合情報」 についてデータ更新を行いました。

「核酸医薬品データベース」 (産業技術総合研究所 福井一彦研究チーム長)を更新しました

「核酸医薬品データベース」は、バイオ医薬品として知られる核酸医薬品の承認薬や、臨床試験における治験段階の情報をまとめたものです。
今回の更新では、2件の承認薬レコードに核酸配列情報を追加しました。

「Mouse Basement Membrane Bodymap」 (大阪大学蛋白質研究所 関口清俊教授)を追加しました

「Mouse Basement Membrane Bodymap」は、発生中のマウス胚における基底膜タンパク質の局在性を示す画像のデータベースです。

「日化辞 InChI対応表」 (国立研究開発法人 科学技術振興機構)のデータを更新しました

「日化辞 InChI対応表」は日本化学物質辞書(日化辞)の化合物IDとInChIおよびInChIKeyの対応に関するデータベースです。

今回の更新では、「InChI対応表」 について、以下のデータ更新を行いました。

  • レコードの統廃合 (3 化合物)
  • レコードの削除 (1 化合物)
  • InChIおよびInChIKey変更 (3,772 化合物)
  • 新規追加 (166,294 化合物)

 

「核酸医薬品データベース」 (産業技術総合研究所 福井一彦研究チーム長)を追加しました

「核酸医薬品データベース」は、バイオ医薬品として知られる核酸医薬品の承認薬や、臨床試験における治験段階の情報をまとめたものです。

「YAKUZEN」 (奈良先端科学技術大学院大学 金谷重彦教授)を追加しました

「YAKUZEN」はKNApSAcK Familyの1つで、食材が持つ効能 (性味,帰経など) と薬膳レシピのデータベースです。

「jPOSTリポジトリメタデータ」 (京都大学薬学部 石濱泰教授)を追加しました

jPOSTリポジトリは、質量分析の生データ、ピークリスト、解析データのリポジトリです。「jPOSTリポジトリメタデータ」は、このリポジトリのメタデータをまとめたものです。

「KEGG MEDICUS」(京都大学化学研究所 金久實特任教授)を更新しました

「KEGG MEDICUS」は疾患・医薬品・環境物質などのデータを、ゲノム情報を基盤とした生体システム情報として統合したデータベースです。 今回の更新では、新たに「Dgroup」データを追加し、「Drug」「Environ」 および 「Disease」 のデータを更新しました。

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