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生命科学系データベースアーカイブ

「ChemTHEATRE」 (愛媛大学 仲山慶講師)を更新しました

「ChemTHEATRE」は、環境中の化学物質のモニタリング結果を集めたデータベースです。

「RefEx」 (ライフサイエンス統合データベースセンター 小野浩雅特任助教)を追加しました

「RefEx」は、4種類の測定方法による各組織における遺伝子発現状況の数値データのデータベースです。

「LigandBox」(産業技術総合研究所 福西快文研究チーム長)を追加しました

「LigandBox」は、計算機によるバーチャルスクリーニング用の低分子化合物のデータベースです。

「核酸医薬品データベース」 (産業技術総合研究所 福井一彦研究チーム長)を更新しました

「核酸医薬品データベース」は、核酸医薬品について承認薬や、臨床試験における治験段階の情報をまとめたデータベースです。

今回の更新では、6件のレコードを追加しました。

「jPOSTリポジトリ」 (京都大学薬学部 石濱泰教授)を更新しました

jPOSTリポジトリは、質量分析の生データ、ピークリスト、解析データのリポジトリです。今回の更新では、jPOSTリポジトリのメタデータをまとめたもの(従来「jPOSTリポジトリメタデータ」として本アーカイブで公開)に加えて、jPOSTリポジトリの全公開データが本アーカイブからダウンロードできるようになりました。

「SPD」(福井工業大学 小松節子教授)を追加しました

「SPD」は、浸水ストレス下のダイズから得られたプロテオーム、トランスクリプトーム、メタボロームのデータベースです。

「カイコ参照トランスクリプトームデータ」(農研機構生物機能利用研究部門/農業情報研究センター 横井翔主任研究員)を追加しました。

「カイコ参照トランスクリプトームデータ」は、カイコの新規参照ゲノム配列とカイコP50T系統における複数の器官由来のRNAseqデータから確立した参照トランスクリプトームデータとその関連データです。

「GGGenome dataset」(ライフサイエンス統合データベースセンター 内藤雄樹特任助教)を追加しました。

「GGGenome dataset」は、ゲノムや転写産物から塩基配列を高速に漏れなく検索するツールであるGGGenome用の検索データです。

「KNApSAcK Core」(奈良先端科学技術大学院大学 金谷重彦教授)を更新しました

「KNApSAcK Core」は、二次代謝物と生物種の関係についてのデータベースです。

今回の更新では、生物種-代謝物関係データのデータ項目およびレコードを追加しました。

「科学技術用語形態素解析辞書」(バイオサイエンスデータベースセンター)のデータを更新しました。

「科学技術用語形態素解析辞書」は、JSTシソーラスの見出し語と同義語を、形態素解析エンジンMeCabのユーザー辞書として使える形にしたものです。

今回は「JSTシソーラス見出し語・同義語辞書」を更新しました。ライフサイエンス分野と電子計算機分野の同義語の読みをNBDCで独自に付与しています。

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