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生命科学系データベースアーカイブ

「PGDBj 登録生物種リスト・マーカーリスト・QTLリスト・DBリンク・ゲノム解析手法」(かずさDNA研究所 田畑哲之所長)を更新しました

「PGDBj 登録生物種リスト・マーカーリスト・QTLリスト・DBリンク・ゲノム解析手法」はモデル生物と作物を含む植物種について、基本情報、マーカー、QTL、DBリンク、ゲノム解析手法の情報を整理したデータベースです。
今回の更新では、「登録生物種リスト」「マーカーリスト」 および 「QTLリスト」 のデータを更新しました。

「GENIUS II」(青山学院大学 諏訪牧子教授)を追加しました。

「GENIUS II」は、各生物種ゲノムの全ORFを多重媒介配列検索法(MISS法)を用いて構造既知のタンパク質の立体構造に帰属したデータベースです。

「HATODAS」 (理化学研究所 国島直樹グループディレクター)を更新しました

「HATODAS」はタンパク質のX線結晶解析で行われる重原子化の事例を収集したデータベースです。
今回の更新では、「重原子レコード」 および 「モチーフ」 のデータを更新しました。

「GRIPDB」 (東京電機大学 根本航准教授)を追加しました

「GRIPDB」は、Gタンパク質共役型受容体同士の相互作用ペアについての情報を提供するデータベースです。

「MicrobeDB.jp」(国立遺伝学研究所 黒川顕教授)を更新しました

「MicrobeDB.jp」はゲノム情報を核として様々な微生物学上の知識を統合したデータベースです。
今回の更新では、「Disease」「GOLD」「NCBI」「Ortholog」の4つのデータセットを追加しました。
また、「BRC」「Ontology」「Refsequence」(「Refseq」から名称変更)、「SRA」(「SRS」から名称変更)の4つのデータセットを更新しました。

「Togo Picture Gallery」 (ライフサイエンス統合データベースセンター 小野浩雅特任助教)を追加しました

「Togo Picture Gallery」は、生命科学分野で使える画像コレクションです。

「TogoTV」 (ライフサイエンス統合データベースセンター 小野浩雅特任助教)を追加しました

「TogoTV」は、生命科学分野の有用なデータベースやツールの使い方を紹介する動画コレクションです。

「抗体医薬品データベース」 (産業技術総合研究所 福井一彦研究チーム長)を追加しました

「抗体医薬品データベース」は、抗体医薬品について承認薬や臨床試験における3段階の治験段階の情報をまとめたデータベースです。

「SKIP幹細胞情報データベース」 (慶應義塾大学 小崎健次郎教授)を追加しました

「SKIP幹細胞情報データベース」は、各研究機関が保有するヒト幹細胞サンプルに関する情報を集約したデータベースです。

「PGDBj - オルソログデータベース」(大阪大学 中谷明弘特任教授)を更新しました

「PGDBj - オルソログデータベース」は、異なる生物種間におけるアミノ酸配列の類似性に基づいた遺伝子のオルソログ情報を蓄積したデータベースです。

今回の更新では、以下の6つのデータを更新しました。

  • PGDBj - オルソログデータベース
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