| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| About Libraries | AcEST | 10.18908/lsdba.nbdc00839-005 |
ホウライシダ EST（AcEST, Adiantum capillus-veneris EST）のcDNAライブラリーに関する情報。CSV 形式テキストファイル。 |
acest_library.zip
(2KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/archive_acest_library |
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4件 |
データ詳細
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| AcEST | AcEST | 10.18908/lsdba.nbdc00839-001 |
ホウライシダEST（Adiantum capillus-veneris）配列とそのアノテーション（Clone ID、ライブラリ名、Blastx検索結果等）。CSV 形式テキストファイル。 |
acest_est.zip
(110MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/archive_acest |
キャピラリーシーケンサー |
機能アノテーション（UniProtKB/Swiss-Prot 、及びUniProtKB/TrEMBLデータベースとの間のblastx検索結果） |
30,540件 |
データ詳細
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| AcEST Contig | AcEST | 10.18908/lsdba.nbdc00839-004 |
ホウライシダ EST（AcEST, Adiantum capillus-veneris EST）から構成されるコンティグ配列の情報。CSV 形式テキストファイル。 |
acestcontig.zip
(1.34MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/archive_acestcontig |
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4,298件 |
データ詳細
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| BlastX Result : Swiss-Prot | AcEST | 10.18908/lsdba.nbdc00839-002 |
ホウライシダ EST（AcEST, Adiantum capillus-veneris EST）配列と、UniProtKB/Swiss-Prot(release 56.9) データベースとの間でblastx検索を実行した結果。 Blastxヒットリストのうち、各ヒットのアラインメント情報を一つの行に記載。CSV 形式テキストファイル。 |
blasthits_sp.zip
(7.77MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/archive_acest_blasthits_sp |
blastx検索 |
ホウライシダEST配列と、UniProtKB/Swiss-Protデータベースとの間のblastx検索を実行した。 |
282,196ヒット |
データ詳細
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| BlastX Result : TrEMBL | AcEST | 10.18908/lsdba.nbdc00839-003 |
ホウライシダ EST（AcEST, Adiantum capillus-veneris EST）配列と、UniProtKB/TrEMBL(release 39.9) データベースとの間でblastx検索を実行した結果。Blastxヒットリストのうち、各ヒットのアラインメント情報を一つの行に記載。 CSV 形式テキストファイル。 |
blasthits_tr.zip
(7.03MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/archive_acest_blasthits_tr |
blastx検索 |
ホウライシダEST配列と、UniProtKB/TrEMBL データベースとの間でblastx検索を実行した。 |
303,873ヒット |
データ詳細
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|
| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |
データのメタデータ一覧