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項目名 項目の説明
Bait ORF

BaitのORF名、SGD(Saccharomyces Genome Database;http://www.yeastgenome.org/) におけるSystematic Name

Bait gene name

Baitの遺伝子名、SGDにおけるStandard Name

Bait description

Baitのアノテーション、SGDにおけるDescription

Rows with this bait as bait

このBait ORFをBait ORFとして持つ行(相互作用)の数、検索結果へのリンク(TogoDBのみ)

Rows with this bait as prey

このBait ORFをPrey ORFとして持つ行(相互作用)の数、検索結果へのリンク(TogoDBのみ)

Prey ORF

PreyのORF名、SGD(Saccharomyces Genome Database;http://www.yeastgenome.org) におけるSystematic Name

Prey gene name

Preyの遺伝子名、SGDにおけるStandard Name

Prey description

Preyのアノテーション、SGDにおけるDescription

Rows with this prey as prey

このPrey ORFをPrey ORFとして持つ行(相互作用)の数、検索結果へのリンク(TogoDBのみ)

Rows with this prey as bait

このPrey ORFをBait ORFとして持つ行(相互作用)の数、検索結果へのリンク(TogoDBのみ)

Literature on bait(YPD)

Baitに関する文献数、YPD(Yeast Proteome Database)(*1)か ら取得

Literature on prey(YPD)

Preyに関する文献数、YPDから取得

Literature shared by bait and prey

Bait,Preyに関して共通する文献数、YPDから取得した文献数に基づき計算

Literature sharing score

PreyとBaitで、文献中の共起に関するスコアを計算式に基づき計算スコアの計算式:

CuraGen(0 or 1)

CuraGenによる調査(0または1)、Uetz et al.(*2)か ら取得

S. Fields(0 or 1)

S.Fieldsによる調査(0または1)、Uetz et al.から取得

Association(0 or 1,YPD)

会合(0または1)、YPDから取得

Complex (0 or 1,YPD)

複合体形成(0または1)、YPDから取得

Co-induced by(YPD)

両遺伝子の発現を誘導する因子、YPDから取得

Co-repressed by(YPD)

両遺伝子の発現を抑制する因子、YPDから取得

Not affected by(YPD)

これらの遺伝子の発現に影響のない因子、YPDから取得

Expression similarity (BRITE)

KEGG BRITE(*4)か らの取得した発現データ。(値が0.9以上の高いもののみ)

Alternative path with 1 intervening protein

一つの中間蛋白質を介したこの相互作用以外のパスの数をフルデータから計算

Alternative path with 2 intervening proteins

二つの中間蛋白質を介したこの相互作用以外のパスの数をフルデータから計算

IST hit

Interaction Sequence Tags(IST)のヒット数(相互作用の検出数、再現性の指標)

IST hit in the opposite bait/prey orientation

BaitとPreyが反転した組み合わせのIST hitの数

Synthetic lethality(0 or 1,YPD)

合成致死性(0または1)、YPDから取得

Interologs

相互作用するタンパク質の対他生物種のオーソログ間に存在するインタラクションの数、Database of Interacting Proteins(*3)か ら取得