| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
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| QTL情報 | Q-TARO | 10.18908/lsdba.nbdc01234-001 |
代表的QTL情報です。代表的QTLは、463件の論文に由来する1051件のQTL情報から構成されています(2008年3月31日現在)。 |
qtaro_sjis.zip (Shift JIS)
(89 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/qtaro |
下記文献検索サイトで得たイネのQTL研究に関する論文1214件から、5096件のイネQTL情報を得ました。
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取得したイネQTL情報に対して、統計上検出された遺伝子座間相互作用あるいは遺伝子×環境間相互作用のQTLは排除しました。さらに染色体上の同一カ所に検出されたQTLを整理し、QTL物理位置の同じ形質名を持ち同じインターバルに検出されたQTLを統一することによって、冗長性の少ない代表的QTL情報を得ました。 |
1,051 件 |
データ詳細
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| Whole mount in situ hybridization法 による発現解析結果の顕微鏡画像 | RA target genes in the Ciona embryo | 10.18908/lsdba.nbdc00960-002 |
マイクロアレイ実験によってスクリーニングされたレチノイン酸標的遺伝子のWhole mount in situ hybridization法 による発現解析結果の顕微鏡画像 |
ra_target_gene_insitu.zip
(29.6MB) |
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Whole mount in situ hybridization法 |
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453ファイル |
データ詳細
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| マイクロアレイとin situ hybridizationによる発現解析(概要版) | RA target genes in the Ciona embryo | 10.18908/lsdba.nbdc00960-001 |
4回のマイクロアレイ実験から得られたデータと、マイクロアレイ実験によりスクリーニングされたレチノイン酸標的遺伝子のWhole mount in situ hybridization法による発現解析結果。 マイクロアレイ実験結果については、概要版(簡易検索)では、要約のみを掲載する。 各アレイの蛍光強度などのデータの詳細については、オリジナル版にまとめられている。 |
概要版: ra_target_gene.zip
(177KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/ra_target_gene |
カタユウレイボヤ EST 解析に用いた卵割期・尾芽胚・幼生のライブラリーから、重複のない 9287 クローンの cDNA を載せたマイクロアレイを作製 |
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9299件 |
データ詳細
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| ESTデータ | RED | 10.18908/lsdba.nbdc00315-006 |
Rice8987 Arrayのクローンの染色体上の位置情報リスト |
red_est.zip
(629 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/red_est |
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9,216件 |
データ詳細
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| サンプル情報 | RED | 10.18908/lsdba.nbdc00315-004 |
コントロール検体またはターゲット検体として使用されたサンプルの情報 |
red_sample.zip
(27.5 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/red_sample |
サンプルはコントロール検体またはターゲット検体として実験で使用されました。 |
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1,224件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |
データのメタデータ一覧