データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 実験の概要 | RED | 10.18908/lsdba.nbdc00315-002 |
ラウンド毎のサンプル組み合わせを含む実験の概要 |
red_experiment_outline.zip
(7.8 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/red_experiment_outline |
- |
- |
1,156件 |
データ詳細
open_in_full
|
| 実験情報 | RED | 10.18908/lsdba.nbdc00315-003 |
アレイglass毎の実験の詳細情報 |
red_experiment_info.zip
(20.3 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/red_experiment_info |
- |
- |
2,158件 |
データ詳細
open_in_full
|
| 発現データ | RED | 10.18908/lsdba.nbdc00315-005 |
実験で得られた正規化発現データ |
red_expression.zip
(85.5 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/red_expression |
このテーブルには、Rice 9000 cDNAアレイにハイブリダイズした様々なRNAを用いた実験由来の正規化発現データが含まれています（25個の生理カテゴリーにおける600回超の実験）。実験はイネマイクロアレイプロジェクト、及び、他の研究グループにより行われました。 |
データは、PRIM（processing implementation for microarray）フィルタリング、及び、不均一なセクターを除去するためにスライドガラス上の各スポッティングセクターで行われた「sector median」正規化を含むデータ処理により、正規化されました。すべての発現データは、発現比の値として示されています。 |
7,151,065件 |
データ詳細
open_in_full
|
| 研究グループと研究課題 | RED | 10.18908/lsdba.nbdc00315-001 |
研究グループと研究課題に関する各年度の情報 |
red_subject_info.zip
(5.2 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/red_subject_info |
- |
- |
174件 |
データ詳細
open_in_full
|
| サンプル情報 | RED II INAHO | 10.18908/lsdba.nbdc01557-003 |
コントロール検体またはターゲット検体として使用されたサンプルの情報 |
redii_inaho_sample.zip
(11.4 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/redii_inaho_sample |
サンプルはコントロール検体またはターゲット検体として実験で使用されました。 |
- |
1,232 件 |
データ詳細
open_in_full
|
| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |