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このデータベースについて

ESTデータ

データ説明
データ名
ESTデータ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00315-006
データ内容の説明
Rice8987 Arrayのクローンの染色体上の位置情報リスト
データファイル
データファイル名 :
red_est.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
629 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/red_est
データ取得方法

-

解析方法

-

データ件数

9,216件

データ詳細
項目名 項目の説明
Element No(Glass)

エレメント番号(アレイglass上の位置情報)

Clone name

クローン名

Accession_01

DDBJ アクセッション番号(5'末端)

Accession_02

DDBJ アクセッション番号(3'末端)

Locus name

遺伝子座

Chr type

染色体番号

EST cluster type

クラスタータイプ

D : クローン配列を直接ゲノムへマッピング
G : 類似配列グループの代表クローン配列をゲノムへマッピング

Availability

利用可能かどうか

true : 利用可
false : 利用不可

3'UTR M /no check

PCR産物のチェック結果(3'UTR)

空欄:結果は予測バンド位置と一致
no : no band
m : multiband

Full insert M /no check

PCR産物のチェック結果(Full inserts)

空欄:結果は予測バンド位置と一致
no : no band
m : multiband

Destination Plate

PCRチェックを行う際に使用したDestination Plateの番号

Dplate Pos

PCRチェックを行う際に使用したDestination Plate上での位置

Mapped 3'UTR Primer seq (Upper)

マップされた3'UTRプライマー配列(Upper)

Mapped 3'UTR Primer seq (Lower)

マップされた3'UTRプライマー配列(Lower)

Unmapped 3'UTR Primer seq (Upper)

マップされていない3'UTRプライマー配列(Upper)

Unmapped 3'UTR Primer seq (Lower)

マップされていない3'UTRプライマー配列(Lower)

Putative Identification

クローン配列から推定されたGene Identification