プールしたDNAを定量的蛍光PCR-SSCP解析して得られた、日本人及び西欧人でのSNPアレル頻度

日本人8人について、DBTSSに記載された遺伝子転写開始点周辺（上流1 kb、下流0.2 kb）の配列をサンガー法でシークエンス解析し、SNPを同定した。次にそのSNPを含む短断片についてプールDNA-蛍光PCR-SSCP法（ABI3100シークエンサーを利用、Kukita et al. 2002, Baba et al. 2003）を行い、該当するSNPの日本人集団および西洋人集団におけるアレル頻度を決定した（Tahira et al. 2005)。このほかに、全身性エリテマトーデスに関連する候補ＳＮＰを症例および対照のプールDNAで解析した結果（Miyagawa et al. 2008 および坂口ら、日本分子生物学会 2005）、乳がんに関連する候補ＳＮＰを症例および対照のプールDNAで解析した結果（宮城ら、日本癌学会学術総会 2004）を含む。

複数の個人（ほとんどの場合、8人）で標的配列（STS）をPCR増幅し、シーケンスすることによって同定されたSNPおよび周辺配列

個人のDNAをPCR増幅しサンガー法でシークエンス解析を行った。SNP配列は、Phred/Phrap/Polyphredソフトウエア(http://www.phrap.org/; http://droog.gs.washington.edu/polyphred/) を用いて検出し、目視により確認した。挿入・欠失変異は我々が独自開発したソフトウエアにより行った（三浦ら、特許第4009481号）。

パン酵母は、ドライイースト製造の過程で過酷な乾燥ストレスに曝されます。我々は、乾燥ストレス耐性に必要な遺伝子を明らかにすることを目的に、出芽酵母の非必須遺伝子の破壊株セットを用いたゲノムワイドなスクリーニングを行いました。その結果、乾燥ストレス感受性を示す278株の遺伝子破壊株を同定することが出来ました。感受性株の破壊遺伝子の中には、液胞酸性化を担う液胞型プロトンATPaseやミトコンドリア機能に関与するものが多く含まれていました。これらの機能は、乾燥ストレスによって液胞酸性化欠損株の細胞内pHが顕著に低下すること、および乾燥ストレスによってミトコンドリア膜電位が喪失することから、乾燥ストレス耐性において重要な役割を担っている可能性が示唆されました。乾燥ストレス感受性と酸化ストレス感受性との関連について調べたところ、酸化ストレスは乾燥ストレスに対する感受性を決定付ける重要な要素であるにも関わらず、酸化ストレス耐性への関与が知られている活性酸素種消去システムは、乾燥ストレス耐性には必須ではない可能性が示唆されました。

YPD培地で30℃で25時間（非ストレスの対照では16時間）培養した後の630nmのODをマイクロタイタープレートリーダー（Elx800）で測定