このデータベースについて
配列データ
| データ説明 | |||||||||||||||
データ名
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配列データ | ||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00042-002 |
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データ内容の説明
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複数の個人（ほとんどの場合、8人）で標的配列（STS）をPCR増幅し、シーケンスすることによって同定されたSNPおよび周辺配列 | ||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
dbqsnp_fasta.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
1.0 MB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dbqsnp_fasta | ||||||||||||||
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データ取得方法
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個人のDNAをPCR増幅しサンガー法でシークエンス解析を行った。SNP配列は、Phred/Phrap/Polyphredソフトウエア(http://www.phrap.org/; http://droog.gs.washington.edu/polyphred/) を用いて検出し、目視により確認した。挿入・欠失変異は我々が独自開発したソフトウエアにより行った（三浦ら、特許第4009481号）。 |
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解析方法
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ここで解析したSNPは順次NCBIのdbSNPに登録した（ハンドル名：KYUGEN)。 |
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データ件数
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10,848 件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||
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