データベースの説明

データベース全般
名称	dbQSNP
名称の読み方	ディービーキュースニップ
別名	Database of SNPs in human genome with allele frequency information
DOI	10.18908/lsdba.nbdc00042-000
作成者	作成氏名林健志* 作成者英名 Kenshi Hayashi* 作成者所属九州大学生体防御医学研究所附属遺伝情報実験センター（作成時）作成者の文献検索作成氏名田平知子作成者英名 Tomoko Tahira 作成者所属九州大学生体防御医学研究所附属遺伝情報実験センター（作成時）作成者の文献検索作成氏名日笠幸一郎作成者英名 Koichiro Higasa 作成者所属九州大学生体防御医学研究所附属遺伝情報実験センター（作成時）作成者の文献検索
連絡先	金城学院大学薬学部田平知子 E-mail:
データベース分類	ヒト遺伝子/疾患-多型データベース全般
生物種	Taxonomy Name Homo sapiens Taxonomy ID 9606
データベースの説明	ヒトゲノム上のSNPを検索し，そのアレル頻度を種々のプールDNAのSSCP解析により決定した結果を表示する。
データベースの特長・有用性・活用方法	主に転写開始点周辺に分布するSNPを探索し、その種々のヒト集団でのアレル頻度をプールDNA-SSCP解析によって高精度で決定しており、様々な表現型を支配する遺伝的背景の解析に役立つ。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称文部科学省　21世紀型革新的先端ライフサイエンス技術開発プロジェクト(2002~2005年度）「テイラーメイド医療基盤整備プログラム」
論文等	文献名 dbQSNP: a database of SNPs in human promoter regions with allele frequency information determined by single-strand conformation polymorphism- based method 著者名 Tahira T, Baba S, Higasa K, Kukita Y, Suzuki Y, Sugano S, Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 Human Mutation 2005 Aug. 26(2) 69-77 外部リンク文献名 Precise estimation of allele frequencies of single-nucleotide polymorphisms by a quantitative SSCP analysis of pooled DNA. 著者名 Sasaki T, Tahira T, Suzuki A, Higasa K, Kukita Y, Baba S, Hayashi K. 雑誌名/掲載年月/号 Am J Hum Genet. 2001 Jan;68(1):214-8. 外部リンク文献名 Single-stranded conformational polymorphism analysis using automated capillary array electrophoresis apparatuses. 著者名 Baba S, Kukita Y, Higasa K, Tahira T, Hayashi K. 雑誌名/掲載年月/号 Biotechniques. 2003 Apr;34(4):746-50. 外部リンク文献名 Software for machine-independent quantitative interpretation of SSCP in capillary array electrophoresis (QUISCA) 著者名 Higasa K, Kukita Y, Baba S, Hayashi K. 雑誌名/掲載年月/号 Biotechniques. 2002 Dec;33(6):1342-8. 外部リンク文献名 Association of polymorphisms in complement component C3 gene with susceptibility to systemic lupus erythematosus. 著者名 Miyagawa H, Yamai M, Sakaguchi D, Kiyohara C, Tsukamoto H, Kimoto Y, Nakamura T, Lee JH, Tsai CY, Chiang BL, Shimoda T, Harada M, Tahira T, Hayashi K, Horiuchi T. 雑誌名/掲載年月/号 Rheumatology (Oxford). 2008 Feb;47(2):158-64 外部リンク文献名 Estimation of SNP allele frequencies by SSCP analysis of pooled DNA 著者名 Tahira T, Kukita Y, Higasa K, Okazaki Y, Yoshinaga A, Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 Methods in Molecular Biology 578:193-207 (2009) 外部リンク文献名 Optimization of capillary array electrophoresis single-strand conformation polymorphism analysis for routine molecular diagnostics 著者名 Jespersgaard C, Larsen LA, Baba S, Kukita Y, Tahira T, Christiansen M, Vuust J, Hayashi K, Andersen PS 雑誌名/掲載年月/号 Electrophoresis 27: 3816-3822 (2006) 外部リンク文献名 Multicolor post-PCR labeling of DNA fragments with fluorescent dideoxynucleotides. 著者名 Kukita Y, Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 BioTechniques 33: 502-506 (2002) 外部リンク文献名 Hemi-stranded SSCP analysis of single-nucleotide polymorphisms in short sequence-tagged sites. 著者名 Kukita Y, Manago S, Baba S, Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 BioTechniques 33:1118-1121 (2002) 外部リンク文献名 SSCP analysis of point mutations by multicolor capillary electrophoresis. 著者名 Hayashi K, Wenz HM, Inazuka M, Tahira T, Sasaki T, Atha DH 雑誌名/掲載年月/号 Methods in Molecular Biology 163: 109-126 (2001) 外部リンク文献名 Recent enhancements in SSCP. 著者名 Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 Genetic Analysis: Biomolecular Engineering 14: 193-196 (1999) 外部リンク文献名 SSCP analysis of long DNA fragments in low pH gel 著者名 Kukita Y, Tahira T, Sommer SS, Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 Human Mutation 10: 400-407 (1997) 外部リンク文献名 One-tube post-PCR fluorescent labeling of DNA fragments 著者名 Inazuka M, Tahira T, Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 Genome Research 6: 551-557 (1996) 外部リンク文献名 PCR-SSCP: A method for detection of mutations 著者名 Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 Genetic Analsysis: Techniques and Applications 9: 73-79 (1992) 外部リンク文献名 PCR-SSCP: A simple and sensitive method for detection of mutations in the genomic DNA 著者名 Hayashi, K 雑誌名/掲載年月/号 PCR Methods and Applications 1: 34-38 (1991) 外部リンク文献名 Rapid and sensitive detection of point mutations and DNA polymorphisms using the polymerase chain reaction 著者名 Orita M, Suzuki Y, Sekiya T, Hayashi K 雑誌名/掲載年月/号 Genomics 5: 874-879 (1989) 外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	九州大学　生体防御医学研究所　附属遺伝情報実験センター　ゲノム構造学分野 ※オリジナルサイトでの公開を終了
オリジナルサイト	（運用終了） http://qsnp.gen.kyushu-u.ac.jp/
運用開始年月日	2002/10/23
最終更新年月日	2008/9/22
統括サイト	(運用終了)
データの一括ダウンロードサイト	(運用終了)
参照先データベース	-
一覧表示	無し
クエリ検索	有り
Webサービス	無し
WebサービスURL	-
ユーザ登録	無し