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データ名 ⇅	データベース名 ⇅	DOI ⇅	説明 ⇅	データ取得方法 ⇅	解析方法 ⇅	データ詳細
Sequence Collection	TMBETA-GENOME	10.18908/lsdba.nbdc00713-001	β-バレル型膜タンパク質の予測を行ったゲノムの一覧。複数の染色体があるゲノムは、染色体ごとにエントリを分けている。	古細菌23セット、細菌237セット、真核生物15セットの計275セットの解読が完了したゲノム情報をNCBIから取得。	-	データ詳細 open_in_full
TMFunctionデータ	TMFunction	10.18908/lsdba.nbdc00714-001	TMFunctionは、α-ヘリックス及びβ-バレル型膜タンパク質に含まれる機能的残基のデータベースです。各タンパク質の名称と由来はUniProtで同定していますが、PDBとも関連づけられるものは、そのIDを示しています。このデータベースには様々な実験手法やパラメータ（例えば、"affinity", "dissociation constant", "IC50", "activity"など）が含まれています。また、タンパク質中の各残基（またはその変異）には、計算または実験によって得られた数値が付与されています。このデータベースで用いた実験データは、ジャーナルの調査及びPubMedのキーワード検索によって得られた文献から収集したものです。さらに完全な参照情報（ジャーナルの引用とPubMed ID）も、このデータベースには含まれています。	UniProt, PDB, PubMed		データ詳細 open_in_full
各種トポロジー予測法の性能検証結果	TMPDB	10.18908/lsdba.nbdc00973-002	膜貫通トポロジーモデルのα構造, Non-redundantセット231件を用いて、各種膜貫通部位予測法の性能を検証した。これらの結果を組み合わせた予測手法Conpred Ⅱの結果をConsensus項目に示している。検証の対象とした予測法は、KKD, Tmpred, TopPred II, DAS, TMAP, MEMSAT 2, SOSUI, PRED-TMR2, TMHMM 2.0, HMMTOP 2.0の10種類。	-	各種予測プログラムにより計算した。	データ詳細 open_in_full
各種トポロジー予測法の性能検証結果	TMPDB	10.18908/lsdba.nbdc00973-007	膜貫通トポロジーモデルのα構造, Non-redundantセット231件を用いて、各種膜貫通部位予測法の性能を検証した。これらの結果を組み合わせた予測手法Conpred Ⅱの結果をConsensus項目に示している。検証の対象とした予測法は、KKD, Tmpred, TopPred II, DAS, TMAP, MEMSAT 2, SOSUI, PRED-TMR2, TMHMM 2.0, HMMTOP 2.0の10種類。SWISS-PROT形式ファイル。リリース6.3。	-	各種予測プログラムにより計算した。	データ詳細 open_in_full
膜貫通トポロジーモデル	TMPDB	10.18908/lsdba.nbdc00973-001	実験結果に基づいた302件の膜貫通トポロジーモデルの情報。文献および関連データベースのエントリー情報を総合的に参照して一型のモデルとして提示している。	PubMed、UniProt等での検索	実験的裏づけのあるものをマニュアルで抽出し、まとめた	データ詳細 open_in_full
データ名	データベース名	DOI	説明	データ取得方法	解析方法	データ詳細