データベース全般 | |
TMFunction | |
ティーエムファンクション | |
Functional Database of Membrane Proteins | |
10.18908/lsdba.nbdc00714-000 | |
Dr. M. MICHAEL GROMIHA | |
構造データベース-タンパク質構造 | |
TMFunctionは、α-ヘリックス及びβ-バレル型膜タンパク質に含まれる機能的残基のデータベースです。各タンパク質の名称と由来はUniProtで同定していますが、PDBとも関連づけられるものは、そのIDを示しています。このデータベースには様々な実験手法やパラメータ(例えば、"affinity", "dissociation constant", "IC50", "activity"など)が含まれています。また、タンパク質中の各残基(またはその変異)には、計算または実験によって得られた数値が付与されています。このデータベースで用いた実験データは、ジャーナルの調査及びPubMedのキーワード検索によって得られた文献から収集したものです。さらに完全な参照情報(ジャーナルの引用とPubMed ID)も、このデータベースには含まれています。 | |
TMFuoctionは、配列データベース(UniProt)、立体構造データベース(PDB)、文献データベース(PubMed)を橋渡ししています。 | |
CC 表示-継承 詳細 | |
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データベースのオリジナルサイト情報 | |
産業技術総合研究所 臨海副都心センター | |
(運用終了) http://tmbeta-genome.cbrc.jp/TMFunction/ | |
2007/7 | |
2008/9 | |
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UniProt, PDB, PubMed | |
有り | |
有り | |
無し | |
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無し |