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項目名 項目の説明
Gene name

遺伝子名

UniProt ID

UniProt ID

UniProt AC

UniProt AC

Date of creation and last modification

TMPDBエントリーの作成日と最終更新日

Description

タンパク質の名称・説明

Journal (Reference)

参考文献の雑誌名、出版年、巻号、頁

Encoded on

遺伝子がコードされているオルガネラ

Organism classification

生物の分類

Localization

細胞内局在部位

Entry and article number

参考文献の番号

Pubmed ID (Reference)

参考文献のPubMed ID

Author (Reference)

参考文献の著書名

Title (Reference)

参考文献のタイトル

Cross-reference

参考データベースのエントリー

Experimental method

トポロジー決定に用いた実験手法

Structural type

構造の型。α、β、α-buried (膜に埋もれているが短くて貫通していないαへリックスを含む。例:aquaporin 1) の3つに分類。

# of TM segments (NS)

膜貫通セグメントの数

Topology (TP)

トポロジー (N, C末端の膜に対する向き)

Feature table data (FT)

TRANSMEM・・・ 膜貫通セグメントの判定結果 SIGNAL, DOMAINなどその他・・・ シグナル配列やドメインなどの配列情報 CONFLICT・・・ データベース間でのアミノ酸配列の相違

NS, FT by KKD

KKDによる予測結果 (項目 NS, FTのTRANSEM)

NS, TP, FT by Tmpred

Tmpredによる予測結果 (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)

NS, TP, FT by TopPred II

TopPred IIによる予測結果 (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)

NS, FT by DAS

DASによる予測結果 (項目 NS, FTのTRANSEM)

NS, TP, FT by MEMSAT 2

MEMSAT 2による予測結果 (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)

NS, FT by SOSUI

SOSUIによる予測結果 (項目 NS, FTのTRANSEM)

NS, TP, FT by PRED-TMR2

PRED-TMR2による予測結果 (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)

NS, TP, FT by HMMTOP 2.0

HMMTOP 2.0による予測結果 (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)

NS, TP, FT Consensus

ConpredⅡによるコンセンサス (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)

Sequence

アミノ酸配列

Species

生物種

NS, TP, FT by TMAP

TMAPによる予測結果 (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)

NS, TP, FT by TMHMM 2.0

TMHMM 2.0による予測結果 (項目 NS, TP, FTのTRANSEM)