データベース全般 | |
 名称 | TMPDB |
| 名称の読み方 | ティーエムピーディービー |
| 別名 | TransMembrane Protein DataBase |
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00973-000 |
| 作成者 | |
| 連絡先 | 〒036-8561 弘前市文京町3番地 |
| データベース分類 | タンパク質配列データベース-タンパク質の局在とターゲッティング |
| 生物種 | - |
| データベースの説明 | 収集した膜貫通トポロジーに関する文献 (1074論文) から、X線結晶構造回折、NMR、遺伝子融合などの実験によって決定された、信頼度の高い302の膜貫通トポロジーモデルを抽出し、それらをSWISS- PROTなどのデータベースと結びつけることによって、膜貫通トポロジーデータベース (TMPDB) として構築した。 |
| データベースの特長・有用性・活用方法 | TMPDBは膜貫通トポロジー予測法開発や、既存の予測法の改良のためのトレーニングあるいはテストデータセットとして有用である。 |
| データベースの利用許諾 | CC 表示-継承 詳細 |
| 予算的背景・プロジェクト | |
| 論文等 | |
データベースのオリジナルサイト情報 | |
| データベース運用場所 |
※オリジナルサイトでの公開を終了 |
| オリジナルサイト | - |
| 運用開始年月日 | - |
| 最終更新年月日 | 2003/11 |
| 統括サイト | - |
| データの一括ダウンロードサイト | - |
| 参照先データベース | - |
| 一覧表示 | 無し |
| クエリ検索 | 無し |
| Webサービス | 無し |
| WebサービスURL | - |
| ユーザ登録 | 無し |
