データベース全般 | |
 名称 | TMBETA-GENOME |
| 名称の読み方 | ティーエムベータゲノム |
| 別名 | Annotation of Beta-Barrel Membrane Proteins in Genomic Sequences |
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00713-000 |
| 作成者 | |
| 連絡先 | Dr. M. MICHAEL GROMIHA |
| データベース分類 | タンパク質配列データベース-タンパク質属性 |
| 生物種 | |
| データベースの説明 | TMBETA-GENOMEはゲノム配列の解読が完了している生物種のゲノム中に含まれるβ−バレル型膜タンパク質のデータベースです。各ゲノム配列に対して、機械学習と統計的手法を用いた計算が実行され、それらのアノテーション結果がデータベースに格納されています。 |
| データベースの特長・有用性・活用方法 | ゲノムの各配列についてβ-バレル型膜タンパク質と判定された配列をFASTAフォーマットで取得することができ、さらなる解析に用いることができます。また"TMBETA-DISC"や"TMBETA-SVM"などの予測ツールを提供しており（アーカイブ版には含まれません）、アミノ酸配列を入力してβ-バレル型膜タンパク質の判別解析を行うことができます。 |
| データベースの利用許諾 | CC 表示-継承 詳細 |
| 予算的背景・プロジェクト | - |
| 論文等 | |
データベースのオリジナルサイト情報 | |
| データベース運用場所 | 産業技術総合研究所 ゲノム情報研究センター |
| オリジナルサイト | - |
| 運用開始年月日 | - |
| 最終更新年月日 | - |
| 統括サイト | http://medals.jp/list/detail/70.html |
| データの一括ダウンロードサイト | - |
| 参照先データベース | NCBI, Ensembl |
| 一覧表示 | 有り |
| クエリ検索 | 有り |
| Webサービス | 無し |
| WebサービスURL | - |
| ユーザ登録 | 無し |
