データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Keio Collection情報 | GenoBase ver.6 | 10.18908/lsdba.nbdc00077-005 |
本データベースに収録した遺伝子の欠失株であるKeio Collection(http://www.shigen.nig.ac.jp/ecoli/strain/nbrp/explanation/keioCollection.jsp)の情報 |
genobase_v6_ex_deletion.zip
(144KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_ex_deletion |
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3,794件 |
データ詳細
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| Kohara Clone情報 | GenoBase ver.6 | 10.18908/lsdba.nbdc00077-010 |
大腸菌Escherichia coliのゲノムDNAをラムダファージベクターに組み込んで作成した小原クローンの情報 |
kohara_clone.zip
(24KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_kohara_clone |
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467件 |
データ詳細
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| ORF配列情報 | GenoBase ver.6 | 10.18908/lsdba.nbdc00077-007 |
本データベースに収録したORF及びその上流・下流の配列等 |
genobase_v6_seq.zip
(2.78MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_seq |
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4,550件 |
データ詳細
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| PPI実験情報 | GenoBase ver.6 | 10.18908/lsdba.nbdc00077-008 |
ASKA Cloneを使って行ったタンパク質間相互作用の実験情報 |
genobase_v6_ppi.zip
(388KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_ppi |
タンパク質相互作用実験 |
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21,175件 |
データ詳細
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| メインテーブル | GenoBase ver.6 | 10.18908/lsdba.nbdc00077-001 |
ORFと遺伝子の情報を中心に、クローンや配列情報へのリンクを表示したテーブル。GenoBaseデータの全体像を俯瞰することができる。 |
genobase_main.zip
(159KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_main |
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5,626件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |