データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ORF配列 | GENIUS II | 10.18908/lsdba.nbdc00471-003 |
ORF配列（アミノ酸）です |
genius_orf_sequence.zip
(164 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genius_orf_sequence#ja |
RefSeq |
783495 件 |
データ詳細
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| PDBアライメント | GENIUS II | 10.18908/lsdba.nbdc00471-004 |
PDB配列と中間配列との間のPSI-BLAST検索結果（アライメント）へのリンク情報です。 |
genius_pdb_alignment.zip
(23 KB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genius_pdb_alignment#ja |
PDB, nr-aa |
PDB配列と中間配列との間でPSI-BLAST検索を行った。 |
4181 件 |
データ詳細
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| 遺伝子文献情報 | GenLibi | 10.18908/lsdba.nbdc01093-001 |
JST 文献情報から得られた遺伝子機能や関連する疾患／表現型をまとめた一覧です。 |
genlibi.zip
(26 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genlibi |
JST が運営する文献情報提供事業 (JDream II) で提供されている文献情報から、遺伝子に関連する文献を取得しました。 |
取得した文献の内容から、遺伝子名、遺伝子関連疾患名や表現型を抽出しました。 |
216 件 |
データ詳細
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| ASKA Clone情報 | GenoBase ver.6 | 10.18908/lsdba.nbdc00077-004 |
大腸菌Escherichia coliの全遺伝子のプラスミドクローンであるASKA Clone(http://www.shigen.nig.ac.jp/ecoli/strain/nbrp/explanation/askaClone.jsp)と、これを使用して行ったGFPやIPTG実験の情報 |
genobase_aska_clone.zip
(144KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_aska_clone |
GFPやIPTGを使用した実験による |
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5,343件 |
データ詳細
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| ECK-COG情報 | GenoBase ver.6 | 10.18908/lsdba.nbdc00077-003 |
本データベースの遺伝子情報に対応するEscherichia coli K-12株上の遺伝子番号（ECK番号）、及びその相同遺伝子分類（COG番号）と機能 |
genobase_eck_cog.zip
(24KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_eck_cog |
- |
- |
3,953件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |