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GenoBase ver.6
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
GenoBase ver.6
名称の読み方
ジェノベース バージョン6
別名
-
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00077-000
作成者
作成氏名
森 浩禎
作成者英名
Hirotada Mori
作成者所属
奈良先端科学技術大学院大学
連絡先

データベース分類

塩基配列データベース-遺伝子構造、イントロン/エクソン、スプライス部位

生物種
Taxonomy Name
Escherichia coli str. K-12 substr. W3110
Taxonomy ID
データベースの説明

GenoBaseは大腸菌K-12(W3110)の生細胞システムを総合的に理解するためのデータベースである。GenoBaseは大腸菌に関する配列情報、プロテオーム、トランスクリプトーム、バイオインフォマティクス、文献に基づく知識の公共リポジトリである。

データベースの特長・有用性・活用方法

大腸菌K-12(W3110)のORF情報を中心に、遺伝子・クローン・PPI実験・文献等の関連データを収録している。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
NEDOプロジェクトの成果が一部含まれている。
論文等
文献名
Large-scale identification of protein-protein interaction of Escherichia coli K-12.
著者名
Arifuzzaman M, Maeda M, Itoh A, Nishikata K, Takita C, Saito R, Ara T, Nakahigashi K, Huang HC, Hirai A, Tsuzuki K, Nakamura S, Altaf-Ul-Amin M, Oshima T, Baba T, Yamamoto N, Kawamura T, Ioka-Nakamichi T, Kitagawa M, Tomita M, Kanaya S, Wada C, Mori H.
雑誌名/掲載年月/号
Genome Res. 2006 May;16(5):686-91. Epub 2006 Apr 10.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
http://ecoli.aist-nara.ac.jp/index.html
運用開始年月日
2006/05
最終更新年月日
2009/01
統括サイト
-
データの一括ダウンロードサイト
http://ecoli.aist-nara.ac.jp/gb6/Download.html
参照先データベース
一覧表示
無し
クエリ検索
有り
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
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無し