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生命科学系データベースアーカイブ

GenoBase ver.6

ORF配列情報

データ説明

info データ名 ORF配列情報
info DOI 
info データ内容の説明 

本データベースに収録したORF及びその上流・下流の配列等

info データファイル 
データファイル名:
genobase_v6_seq.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/genobase_v6/LATEST/genobase_seq.zip
ファイルサイズ:
2.78MB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

-

info 解析方法 

-

info データ件数 

4,550件

データ詳細

項目名項目の説明
Gene ID 遺伝子のID
Left Point ORFのゲノム上の開始位置
Right Point ORFのゲノム上の終了位置
Direction ORFの向き（5'->3'なら1、3'->5'なら-1、不明なら0）
Map min ゲノム長を100とした場合の、このORFの位置
NT Seq Length ORF配列長
AA Seq Length ORF配列を翻訳したアミノ酸配列長
Start Codon 開始コドン
Stop Codon 終止コドン
Upstream Sequence ORFの上流500bpの配列
Sequence ORF配列
Amino Acid Sequence ORF配列を翻訳したアミノ酸配列
Downstream Sequence ORFの下流200bpの配列