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生命科学系データベースアーカイブ

GenoBase ver.6

PPI実験情報

データ説明

info データ名 PPI実験情報
info DOI 
info データ内容の説明 

ASKA Cloneを使って行ったタンパク質間相互作用の実験情報

info データファイル 
データファイル名:
genobase_v6_ppi.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/genobase_v6/LATEST/genobase_ppi.zip
ファイルサイズ:
388KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

タンパク質相互作用実験

info 解析方法 

-

info データ件数 

21,175件

データ詳細

項目名項目の説明
Gel No ゲルの番号
HIS Tag HISタグの付いたベイトタンパク質を発現する遺伝子のID
Gene 上記の遺伝子の名前
MW ベイトタンパク質の分子量（計算値）
Protein ベイトタンパク質の名前
Sample ID 実験サンプルのID
Coverage 実験で得られたペプチドがアミノ酸配列に占める割合
JW ベイトタンパク質に結合するプレイタンパク質を発現する遺伝子のID
Sharp ID 上記遺伝子のID（JWとは別系統）
Target Gene 上記遺伝子の名前
MW(exp) 結合したペプチドの分子量（実験値）
PI 結合したペプチドの等電点
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