データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| マクロファージの分化、活性化に関する文献リストとそのパスウェイ | DMPD | 10.18908/lsdba.nbdc00558-001 |
キュレーションを行ったマクロファージの分化、活性化に関しての文献リスト。リストは CSV 形式テキストファイル。 |
dmpd.zip
(16KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dynamic_macrophage_pathway_csml_db |
PubMed での検索 |
文献をキュレータが読み、 Cell Illustrator Online (CIO) を用いて CSML フォーマットのパスウェイに変換 |
231件 |
データ詳細
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| Acegeneデータ | DNA ProbeLocator | 10.18908/lsdba.nbdc01077-001 |
DNAチップ研究所 AceGene（Human Oligo Chip 30K）に関するプローブデータです。 |
dnaprobelocator_acegene.zip
(1.2MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_acegene |
DNAチップ研究所から提供しているプローブ情報を取得 |
AceGeneプローブとH-InvII FLcDNA配列の、BLASTによるマッピングを行い、プローブ－配列の対応とブラストスコアを取得しました。 |
207,497件 |
データ詳細
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| Agilentデータ | DNA ProbeLocator | 10.18908/lsdba.nbdc01077-002 |
Agilent社 Agilent-012097 Human 1A Oligo Microarray (V2) (G4110B)
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dnaprobelocator_agilent.zip
(5.4MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_agilent |
Agilent社から提供しているプローブ情報を取得 |
遺伝子・転写物との対応関係をマッピング処理にて取得 |
294,045 件 |
データ詳細
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| Genechipデータ | DNA ProbeLocator | 10.18908/lsdba.nbdc01077-003 |
Affymetrix GeneChip
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dnaprobelocator_genechip.zip
(197MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_genechip |
Affymetrix社から提供しているプローブ情報を取得 |
遺伝子・転写物との対応関係をマッピング処理にて取得 |
5,144,283件 |
データ詳細
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| Hix2snpデータ | DNA ProbeLocator | 10.18908/lsdba.nbdc01077-004 |
H-Invitational cluster上のSNPに関する情報 |
dnaprobelocator_hix2snp.zip
(37.7MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_hix2snp |
H-Invitational DBからデータを取得 |
- |
33,399件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |