Genechipデータ

データ名

Genechipデータ

DOI

データ内容の説明

Affymetrix GeneChip

データファイル

データファイル名:

dnaprobelocator_genechip.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

197MB

簡易検索URL

データ取得方法

Affymetrix社から提供しているプローブ情報を取得

解析方法

遺伝子・転写物との対応関係をマッピング処理にて取得

データ件数

5,144,283件

項目名	項目の説明
probe_set	GeneChipのアレイ名
probe	GeneChipのprobe set名
no	プローブセットにおけるHIT-IDの違いに基づいた通し番号
total_no	プローブセットに対応するHIT-IDの数
hit	H-Invitational transcript ID (HIT)
hix	H-Invitational cluster ID (HIX)
acc	GenBank accession ID
hit_cnt	プローブセット中の特定のHIT 配列に結合するプローブの数
info	プローブマッピング位置情報 (各プローブの開始座標：終了座標：プローブの成分となる配列のID：ストランド：ミスマッチ数)
min_pos	最小座標
max_pos	最大座標

このデータベースについて