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生命科学系データベースアーカイブ

DNA ProbeLocator

データベースの説明

データベース全般

info 名称 DNA ProbeLocator
info 名称の読み方 ディーエヌエプローブロケーター
info 別名 マイクロアレイプローブデータベース
info DOI 
info 作成者 
作成者氏名:
日紫喜光良*
作成者英名:
Teruyoshi Hishiki
作成者所属:
東邦大学
info 連絡先 

（独）産業技術総合研究所
創薬分子プロファイリング研究センター
今西 規（Imanishi Tadashi）
Email: gdbs_address
Tel:（代表）03-3599-8800

info データベース分類 マイクロアレイデータ、その他の発現データのデータベース
info 生物種 
生物種名:
Homo sapiens
Taxonomy ID:
info データベースの説明 

アフィメトリクス、アジレント、ならびにDNAチップ研究所から提供された多様なプラットフォームのマイクロアレイプローブ配列すべてを完全長cDNA配列に対してマッピングした結果を格納しています。

info データベースの特長・有用性・活用方法 

DNA ProbeLocatorはプローブのマッピングデータをエクソン構造と共に、直感的に表現するデータベースです。データはヒトゲノム（build35）を用いており、H-InvDBに格納されている完全長のクローンで検証された遺伝子に関するアノテーション情報を提供します。
現在、下記のプラットフォームのデータが格納されています。

 

  1. Affymetrix GeneChip (HG-Focus, HG-U133A, HG-U133A_2, HG-U133B, HG-U133_Plus_2, HG-U95A,HG-U95Av2, HG-U95B, HG-U95C, HG-U95D, HG-U95E, HuGene FL, HuEx-1_0)
  2. DNA Chip Research Inc. AceGene Human Oligo Chip 30K
  3. I.M.A.G.E. (1673145 clones)
  4. Agilent-012097 Human 1A Oligo Microarray (V2) (G4110B)
  5. Agilent-012391 Whole Human Genome Oligo Microarray (G4112A)

 

info データベースの利用許諾 CC 表示-継承 詳細
info 予算的背景・プロジェクト 
名称:
ゲノム情報統合プロジェクト （経済産業省 2005～2007）
info 論文等 
文献名:
 
著者名:
 
雑誌名/掲載年月/号:
 
外部リンク:
 

データベースのオリジナルサイト情報

info データベース運用場所 


※オリジナルサイトでの公開を終了

info オリジナルサイト -
info 運用開始年月日 2007
info 最終更新年月日 2009
info 統括サイト -
info データの一括ダウンロードサイト -
info 参照先データベース -
info 一覧表示 有り
info クエリ検索 有り
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し