Agilentデータ

データ名

Agilentデータ

DOI

データ内容の説明

Agilent社　Agilent-012097 Human 1A Oligo Microarray (V2) (G4110B)
Agilent社　Agilent-012391 Whole Human Genome Oligo Microarray (G4112A)

データファイル

データファイル名:

dnaprobelocator_agilent.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

5.4MB

簡易検索URL

データ取得方法

Agilent社から提供しているプローブ情報を取得

解析方法

遺伝子・転写物との対応関係をマッピング処理にて取得

データ件数

294,045 件

項目名	項目の説明
probe_set	プローブセットID PGID215:Human 1A Oligo Microarray PGID247:Whole Human Genome Oligo Microarray
probe	プローブ名 (AgilentのSPOT_ID)
no	プローブに結合する複数のHIT_IDにおける通し番号
total_no	プローブが結合するHITの数
hit	H-Invitational transcript ID (HIT)
hix	H-Invitational cluster ID (HIX)
acc	GenBank accession number
hit_cnt	特定のHITへのプローブの結合領域の数
info	プローブの結合位置情報 (結合開始座標：終了座標：ストランド：ミスマッチ数)
min_pos	プローブが結合するHITの中での最小座標
max_pos	プローブが結合するHITの中での最大座標

このデータベースについて