| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| InCeP画像 | CREATE portal | 10.18908/lsdba.nbdc00403-003 |
mKIAAの細胞内情報伝達経路の画像ファイル |
create_portal_images.zip
(13.4 MB) |
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「KeyMolnet data」より |
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76 ファイル |
データ詳細
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| InGaP | CREATE portal | 10.18908/lsdba.nbdc00403-001 |
mKIAA遺伝子のマウス臓器や培養細胞株での発現 |
create_portal_ingap.zip
(57.6 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/create_portal_ingap |
ウェスタンブロット:成体マウス臓器や培養細胞の抽出液をSDS-PAGEで分離し、抗mKIAA抗体と抗ウサギIgG抗体によりHRPで化学発光させた結果をCCDイメージング装置で観察しました。
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274 件 |
データ詳細
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| KeyMolnet data | CREATE portal | 10.18908/lsdba.nbdc00403-004 |
mKIAAの細胞内情報伝達経路のKeyMolnetファイル |
create_portal_keymolnet.zip
(7.1 MB) |
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「Mascot search results」より |
KeyMolnetのソフトを用いて、質量分析の結果同定されたタンパク質情報と既存のタンパク質相互作用の情報を合わせてmKIAAの細胞内情報伝達経路のイメージ図を作成しました。 |
76 ファイル |
データ詳細
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| Mascot search results | CREATE portal | 10.18908/lsdba.nbdc00403-005 |
Mascot解析結果ファイル |
create_portal_mascot.zip
(321 KB) |
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免疫沈降:成体マウスの組織もしくは培養細胞株の抽出液を用いて抗mKIAA抗体を用いた免疫沈降を行いました。
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質量分析:LC-MSによる質量分析の結果をMascot解析し、共沈したタンパク質を予想しました。 |
38 ファイル |
データ詳細
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| Genotype Data (Phase II) | D-HaploDB | 10.18908/lsdba.nbdc00036-005 |
D2(Phase II)の遺伝子型データ。
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mole_info_DhaploD2.txt.gz
(13.7MB) |
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Perlegen 281K arrays、Affymetrix 500K arrays によるSNPジェノタイピング |
Perlegen 281K arraysによる解析については Kukita et al. (2005) に記載のとおりである。Affymetrix 500K arraysによる解析についてはHigasa et al. (2009) に記載されているが論文ではアノテーションにゲノム参照配列 NCBI Build36 を使用しているのに対し、D2では Build35 を使用しており、同じ参照配列を使用したPerlegen 281K arrays の結果と統合している。なお、タイピングの結果、1%以下の割合でヘテロと判定された箇所があるが、これらはエラー判定の可能性が高い(全胞状奇胎ではヘテロは基本的にないはずであり、実際にこれらのコールの再現性も悪い)のですべてノーコールに変換している。 |
581,235件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |
データのメタデータ一覧