データベースの説明

データベース全般
名称	D-HaploDB
名称の読み方	ディーハプロディービー
別名	Definitive Haplotype Database
DOI	10.18908/lsdba.nbdc00036-000
作成者	作成氏名林健志* 作成者英名 Kenshi Hayashi 作成者所属九州大学生体防御医学研究所附属遺伝情報実験センター作成氏名田平知子作成者英名 Tomoko Tahira 作成者所属九州大学生体防御医学研究所附属遺伝情報実験センター
連絡先	金城学院大学薬学部田平　知子 E-mail:
データベース分類	ヒト遺伝子/疾患-多型データベース全般
生物種	Taxonomy Name Homo sapiens Taxonomy ID 9606
データベースの説明	全胞状奇胎を用いて直接決定した日本人ゲノムのハプロタイプおよび連鎖不平衡構造に関する公開データベース。
データベースの特長・有用性・活用方法	全胞状奇胎のゲノムは単一精子に由来するため、D-HaploDBでは直接決定されたハプロタイプの情報が得られる。これに対して、例えばハップマップが提供するアジア人ハプロタイプは推定ハプロタイプであり、ある程度の誤りを含むと考えられる。オリジナルサイトではゲノムブラウザ機能を利用でき、また2011年６月に新規アレイデータ（D4）が追加されている。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称文部科学省　21世紀型革新的先端ライフサイエンス技術開発プロジェクト(2002~2005年度）「テイラーメイド医療基盤整備プログラム」名称文部科学省ゲノム特定研究(2005～2009年度）<a href="https://www.genome-sci.jp/tokutei2005/modules/contents2/rewrite/tc_48.html" target="_blank">「定量的一塩基多型解析技術の開発と医療への応用」</a>
論文等	文献名 Genome-wide definitive haplotypes determined using a collection of complete hydatidiform moles. 著者名 Kukita Y, Miyatake K, Stokowski R, Hinds D, Higasa K, Wake N, Hirakawa T, Kato H, Matsuda T, Pant K, Cox D, Tahira T, Hayashi K. 雑誌名/掲載年月/号 Genome Res. 2005 Nov;15(11):1511-8. 外部リンク文献名 D-HaploDB: a database of definitive haplotypes determined by genotyping complete hydatidiform mole samples. 著者名 Higasa K, Miyatake K, Kukita Y, Tahira T, Hayashi K. 雑誌名/掲載年月/号 Nucleic Acids Res. 2007 Jan;35(Database issue):D685-9. 外部リンク文献名 Evaluation of haplotype inference using definitive haplotype data obtained from complete hydatidiform moles, and its significance for the analyses of positively selected regions. 著者名 Higasa K, Kukita Y, Kato K, Wake N, Tahira T, Hayashi K. 雑誌名/掲載年月/号 PLoS Genetics, 2009 May;5(5):e1000468. 外部リンク文献名 A definitive haplotype map as determined by genotyping duplicated haploid genomes finds a predominant haplotype preference at copy-number variation events. 著者名 Kukita Y, Yahara K, Tahira T, Higasa K, Sonoda M, Yamamoto K, Kato K, Wake N, Hayashi K. 雑誌名/掲載年月/号 Am. J. Hum. Genet. 2010 Jun;86(6):918-28. 外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	九州大学　生体防御医学研究所　附属遺伝情報実験センター　ゲノム構造学分野 http://www.gen.kyushu-u.ac.jp/~genome/index.html ＊オリジナルサイトでの公開を終了
オリジナルサイト	(運用終了)http://orca.gen.kyushu-u.ac.jp/
運用開始年月日	2005/7/20
最終更新年月日	2011/6/23
統括サイト	http://www.gen.kyushu-u.ac.jp/~genome/database.html
データの一括ダウンロードサイト	(運用終了)http://orca.gen.kyushu-u.ac.jp/download.html
参照先データベース	-
一覧表示	無し
クエリ検索	有り
Webサービス	無し
WebサービスURL	-
ユーザ登録	無し