データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| プローブデータ | RED II INAHO | 10.18908/lsdba.nbdc01557-001 |
プローブの情報 |
redii_inaho_probe.zip
(3.1 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/redii_inaho_probe |
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31,791 件 |
データ詳細
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| 実験情報 | RED II INAHO | 10.18908/lsdba.nbdc01557-002 |
サンプル組み合わせを含む実験の概要 |
redii_inaho_experiment.zip
(22.7 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/redii_inaho_experiment |
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1,158 件 |
データ詳細
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| 発現データ | RED II INAHO | 10.18908/lsdba.nbdc01557-004 |
実験で得られた正規化発現データ |
redii_inaho_expression.zip
(101 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/redii_inaho_expression |
このテーブルには、RED（Rice 9K Array）、及び、ARRAY22K（Rice 22k Array）にハイブリダイズした様々な実験由来の正規化発現データが含まれています。 |
データは、PRIM（processing implementation for microarray）フィルタリング、及び、不均一なセクターを除去するためにスライドガラス上の各スポッティングセクターで行われた「sector median」正規化を含むデータ処理により、正規化されました。すべての発現データは、発現比の値として示されています。 |
7,354,240 件 |
データ詳細
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| ID対応表 | RefEx |
遺伝子IDの対応表。 |
refex_id_relation_human.zip
(388 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/refex_data_relationship_matrix |
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データ詳細
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| サンプルアノテーション情報 | RefEx |
各プロジェクトが提供しているサンプルアノテーション情報。
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refex_sample_ann01_cage_human_prjdb1099
(27 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/refex_data_relationship_matrix |
各プロジェクトから取得 |
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データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |