DoBISCUIT
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
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DoBISCUIT
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名称の読み方
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ドゥビスキュイ |
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別名
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- |
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01145-000 |
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作成者
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作成氏名
市川 夏子
作成者英名
Natsuko Ichikawa
作成者所属
独立行政法人製品評価技術基盤機構
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連絡先
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https://www.nite.go.jp/cgi-bin/contact/?cid=00000144&lang=0 |
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データベース分類
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代謝系/シグナル伝達経路 |
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生物種
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データベースの説明
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DoBISCUITは放線菌の二次代謝産物合成遺伝子クラスターに関する情報を網羅的に集約したデータベースです。 |
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データベースの特長・有用性・活用方法
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放線菌によって生成される二次代謝物は、リード化合物や医薬品開発の候補として重要です。ポリケチド合成酵素 (PKS) と非リボソームペプチド合成酵素 (NRPS) は、複雑な化合物の構築における役割で大きな注目を集めています。二次代謝物の生合成遺伝子クラスターは、異種発現やコンビナトリアル生合成などのバイオテクノロジーの用途でよく使用されます。生合成遺伝子クラスターについて記述した科学論文は毎年多数発表されていますが、特定の遺伝子クラスターに関する情報は多くの参考文献に分散しており、網羅的に記述されていません。
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データベースの利用許諾
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CC 表示 詳細 |
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予算的背景・プロジェクト
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-
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論文等
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文献名
DoBISCUIT: a database of secondary metabolite biosynthetic gene clusters.
著者名
Ichikawa, N; Sasagawa, M; Yamamoto, M; Komaki, H; Yoshida, Y; Yamazaki, S and Fujita, N.
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Research (2013) Database Issue Nucleic Acids Res. 2012 Nov 26.
外部リンク
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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データベース運用場所
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独立行政法人製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター |
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オリジナルサイト
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https://www.nite.go.jp/nbrc/pks/ |
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運用開始年月日
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2012/03/28 |
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最終更新年月日
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2016/12/27 |
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統括サイト
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https://www.nite.go.jp/nbrc/index.html |
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データの一括ダウンロードサイト
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参照先データベース
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NCBI, Uniprot, Interpro |
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一覧表示
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有り |
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クエリ検索
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無し |
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Webサービス
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無し |
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WebサービスURL
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ユーザ登録
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無し |