ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for RARA

Query protein: RARA
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3584312 | iPS derived chondrocytes
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
RARA's Target genes

◢ RARA: Average

◢ SRX2748853: Adenoid cystic carcinoma

◢ SRX2748855: Adenoid cystic carcinoma

◢ SRX3584300: iPS cells

◢ SRX3584301: iPS cells

◢ SRX3584302: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584303: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584304: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584305: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584306: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584307: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584308: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584309: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584310: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584311: iPS derived chondrocytes

◣ SRX3584312: iPS derived chondrocytes

◢ SRX3584313: iPS derived chondrocytes

◢ SRX6039037: iPS derived chondrocytes

◢ SRX6039038: iPS derived chondrocytes

◢ SRX6039039: iPS derived chondrocytes

◢ SRX6039040: iPS derived chondrocytes

◢ SRX6039041: iPS derived chondrocytes

◢ SRX6039042: iPS derived chondrocytes

◢ SRX014752: NB-4

◢ SRX014770: NB-4

◢ SRX1035586: SK-N-SH

◢ SRX1035587: SK-N-SH

◢ SRX1035588: SK-N-SH

◢ SRX1035589: SK-N-SH

◢ SRX682379: TSU-1621MT

◢ SRX014781: UPR9

◢ SRX014782: UPR9

◢ RARA: STRING
LOC102724770 ↻ ≫
DGCR6 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
PSMD1 ↻ ≫
TAOK3 ↻ ≫
SUDS3 ↻ ≫
ZNF335 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
RABL2A ↻ ≫
RABL2B ↻ ≫
NME6 ↻ ≫
TLE6 ↻ ≫
POLR3F ↻ ≫
DZANK1 ↻ ≫
CACTIN ↻ ≫
MAPKAPK5 ↻ ≫
DYNC1LI2 ↻ ≫
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PSMG2 ↻ ≫
CEP76 ↻ ≫
RWDD1 ↻ ≫
VDAC2 ↻ ≫
DCTN1 ↻ ≫
MRPS7 ↻ ≫
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GGA3 ↻ ≫
HSPA9 ↻ ≫
TBCK ↻ ≫
AIMP1 ↻ ≫
IPO13 ↻ ≫
FARSB ↻ ≫
FAM187A ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
ZNF576 ↻ ≫
IRGQ ↻ ≫
RPL21 ↻ ≫
VTI1B ↻ ≫
EXOSC5 ↻ ≫
BCKDHA ↻ ≫
ZNF503 ↻ ≫
TSNAX ↻ ≫
HADHB ↻ ≫
HADHA ↻ ≫
REXO1 ↻ ≫
SEC61B ↻ ≫
POLR2E ↻ ≫
GPX4 ↻ ≫
STAM ↻ ≫
C19orf48 ↻ ≫
SKP1 ↻ ≫
NUP205 ↻ ≫
GOSR2 ↻ ≫
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UPF2 ↻ ≫
STAM2 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
ANAPC7 ↻ ≫
S1PR4 ↻ ≫
NCLN ↻ ≫
TTC8 ↻ ≫
ARF1 ↻ ≫
LYRM4 ↻ ≫
FARS2 ↻ ≫
CAPRIN1 ↻ ≫
PROSER1 ↻ ≫
NHLRC3 ↻ ≫
NVL ↻ ≫
COX7A2L ↻ ≫
PAK1IP1 ↻ ≫
C6orf52 ↻ ≫
RHBDD3 ↻ ≫
EWSR1 ↻ ≫
SRD5A1 ↻ ≫
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PNO1 ↻ ≫
DPH6 ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
HOXA3 ↻ ≫
HOXA4 ↻ ≫
ATP5MG ↻ ≫
ACTR10 ↻ ≫
SMC2 ↻ ≫
ADK ↻ ≫
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PES1 ↻ ≫
SELENOF ↻ ≫
HS2ST1 ↻ ≫
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NOTCH2 ↻ ≫
NNAT ↻ ≫
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SLC35B1 ↻ ≫
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OSGEP ↻ ≫
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HSPA1B ↻ ≫
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TLE1 ↻ ≫
PI4KB ↻ ≫
MRPL3 ↻ ≫
RPS23 ↻ ≫
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MRPL11 ↻ ≫
NEUROD1 ↻ ≫
RPS12 ↻ ≫
USP1 ↻ ≫
SF3B3 ↻ ≫
COG4 ↻ ≫
ZRANB2 ↻ ≫
PPP1R1B ↻ ≫
PDAP1 ↻ ≫
BUD31 ↻ ≫
MRPS5 ↻ ≫
ICE1 ↻ ≫
RBKS ↻ ≫
BABAM2 ↻ ≫
RND3 ↻ ≫
UFM1 ↻ ≫
RPS27A ↻ ≫
CLHC1 ↻ ≫
C6orf47 ↻ ≫
BAG6 ↻ ≫
APOM ↻ ≫
PSMD12 ↻ ≫
KITLG ↻ ≫
SFI1 ↻ ≫
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DMRT3 ↻ ≫
TSN ↻ ≫
SART3 ↻ ≫
ISCU ↻ ≫
RPL35A ↻ ≫
IQCG ↻ ≫
NCOR2 ↻ ≫
COMMD1 ↻ ≫
CCT4 ↻ ≫
ZNF608 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
FZD8 ↻ ≫
MSX1 ↻ ≫
GRIK2 ↻ ≫
SEC22B ↻ ≫
FABP7 ↻ ≫
SMPDL3A ↻ ≫
UBE2I ↻ ≫
RPS29 ↻ ≫
LRR1 ↻ ≫
ARL4D ↻ ≫
G6PC2 ↻ ≫
GOLGA5 ↻ ≫
XPNPEP3 ↻ ≫
ST13 ↻ ≫
DNAJB7 ↻ ≫
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MED29 ↻ ≫
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ABCG2 ↻ ≫
PDE4DIP ↻ ≫
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KCNK16 ↻ ≫
LAMA4 ↻ ≫
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MYLK4 ↻ ≫
MSX2 ↻ ≫
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LZTS1 ↻ ≫
PKHD1 ↻ ≫
PCBP1 ↻ ≫
TM9SF1 ↻ ≫
IPO4 ↻ ≫
TSSK4 ↻ ≫
SERINC5 ↻ ≫
ZFHX4 ↻ ≫
PARP11 ↻ ≫
BICRA ↻ ≫
SEMA4D ↻ ≫
FGD3 ↻ ≫
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C1orf105 ↻ ≫
LAMB4 ↻ ≫
OR6B2 ↻ ≫
NDUFA10 ↻ ≫
MUC20 ↻ ≫
FGF19 ↻ ≫
PAM ↻ ≫
SH3BP5 ↻ ≫
ARHGAP11A-SCG5 ↻ ≫
ARHGAP11A ↻ ≫
HOXA5 ↻ ≫
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CABP7 ↻ ≫
PAX3 ↻ ≫
EVX2 ↻ ≫
FAM104A ↻ ≫
C17orf80 ↻ ≫
GMPR ↻ ≫
MYH2 ↻ ≫
DDAH1 ↻ ≫
CCN1 ↻ ≫
USP17L21 ↻ ≫
USP17L20 ↻ ≫
USP17L12 ↻ ≫
USP17L22 ↻ ≫
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ALDH1A2 ↻ ≫
SPRR1A ↻ ≫
DHRS3 ↻ ≫
QPRT ↻ ≫
NFIA ↻ ≫
SHF ↻ ≫
USP17L5 ↻ ≫
USP17L30 ↻ ≫
USP17L29 ↻ ≫
USP17L28 ↻ ≫
USP17L27 ↻ ≫
USP17L26 ↻ ≫
USP17L25 ↻ ≫
USP17L24 ↻ ≫
MRTO4 ↻ ≫
EMC1 ↻ ≫
KCNK10 ↻ ≫
EIF2S3 ↻ ≫
POU2F2 ↻ ≫
LRATD2 ↻ ≫
ACSS3 ↻ ≫
CBFA2T2 ↻ ≫
RARA ↻ ≫
GUCY2C ↻ ≫
SDK2 ↻ ≫
SGPP2 ↻ ≫
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UNCX ↻ ≫
LARP7 ↻ ≫
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SEC11C ↻ ≫
PDE1B ↻ ≫
SMUG1 ↻ ≫
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TRABD2B ↻ ≫
CHODL ↻ ≫
TRMT9B ↻ ≫
SYNPO ↻ ≫
CD69 ↻ ≫
TMEM72 ↻ ≫
CHD7 ↻ ≫
CITED2 ↻ ≫
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SPARCL1 ↻ ≫
TLE4 ↻ ≫
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WDPCP ↻ ≫
HOXB1 ↻ ≫
RFX2 ↻ ≫
C10orf90 ↻ ≫
ITGB6 ↻ ≫
BRINP1 ↻ ≫
PIN4 ↻ ≫
FOXB2 ↻ ≫
HSPA6 ↻ ≫
USP17L13 ↻ ≫
USP17L11 ↻ ≫
USP17L18 ↻ ≫
USP17L10 ↻ ≫
COL17A1 ↻ ≫
CA2 ↻ ≫
TPO ↻ ≫
GAS2L3 ↻ ≫
SKIL ↻ ≫
PIGX ↻ ≫
CEP19 ↻ ≫
HES1 ↻ ≫
LRIG3 ↻ ≫
NR2F1 ↻ ≫
HMX2 ↻ ≫
BUB3 ↻ ≫
CEBPA ↻ ≫
SMARCA2 ↻ ≫
MEF2C ↻ ≫
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WBP1L ↻ ≫
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RPL7 ↻ ≫
RDH10 ↻ ≫
CLDN11 ↻ ≫
PDE1A ↻ ≫
GNG12 ↻ ≫
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CCDC33 ↻ ≫
SLC2A9 ↻ ≫
ZSWIM6 ↻ ≫
IKBKB ↻ ≫
CCDC198 ↻ ≫
SLA ↻ ≫
TRPM3 ↻ ≫
LMLN ↻ ≫
NEUROG2 ↻ ≫
NEUROG3 ↻ ≫
DUSP29 ↻ ≫
ICMT ↻ ≫
HES3 ↻ ≫
NFKBIL1 ↻ ≫
DDX39B ↻ ≫
ATP6V1G2 ↻ ≫
MBTPS1 ↻ ≫
CDX2 ↻ ≫
PTGES2 ↻ ≫
ARHGAP10 ↻ ≫
VEZT ↻ ≫
FGD6 ↻ ≫
PMAIP1 ↻ ≫
HOXA1 ↻ ≫
TAF9 ↻ ≫
RAD17 ↻ ≫
AK6 ↻ ≫
ZP4 ↻ ≫
HOXA2 ↻ ≫
SUCLG1 ↻ ≫
ATOH1 ↻ ≫
NEUROG1 ↻ ≫
STK36 ↻ ≫
RNF25 ↻ ≫
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ZGPAT ↻ ≫
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PDE12 ↻ ≫
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STX5 ↻ ≫
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BBS9 ↻ ≫
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NHS ↻ ≫
RARB ↻ ≫
ADNP2 ↻ ≫
ARID3C ↻ ≫
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S100A10 ↻ ≫
UNKL ↻ ≫
CNPY2 ↻ ≫
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PCBD2 ↻ ≫
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PDHX ↻ ≫
APIP ↻ ≫
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C16orf91 ↻ ≫
CDC73 ↻ ≫
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TLE2 ↻ ≫
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MAMDC2 ↻ ≫
ZNF585B ↻ ≫
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SYBU ↻ ≫
ID3 ↻ ≫
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TPRA1 ↻ ≫
FOXP2 ↻ ≫
SP5 ↻ ≫
CERCAM ↻ ≫
RBPJ ↻ ≫
MAB21L2 ↻ ≫
NFE2 ↻ ≫
ASXL3 ↻ ≫
NAV3 ↻ ≫
CDH18 ↻ ≫
KDM2B ↻ ≫
ARID3B ↻ ≫
TMEM107 ↻ ≫
ME3 ↻ ≫
CLGN ↻ ≫
ZNF746 ↻ ≫
FAM222A ↻ ≫
KCNN4 ↻ ≫
GATA4 ↻ ≫
MEIS2 ↻ ≫
HOXC6 ↻ ≫
TMEM70 ↻ ≫
RGS12 ↻ ≫
ELOC ↻ ≫
CNTN1 ↻ ≫
GPR108 ↻ ≫
MALRD1 ↻ ≫
MYRIP ↻ ≫
ID1 ↻ ≫
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TRIM65 ↻ ≫
MRPL38 ↻ ≫
FOXP1 ↻ ≫
PAH ↻ ≫
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RBBP7 ↻ ≫
GADD45G ↻ ≫
METTL24 ↻ ≫
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DSCAML1 ↻ ≫
TLE3 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
POP5 ↻ ≫
SP2 ↻ ≫
GRSF1 ↻ ≫
HOXB4 ↻ ≫
IL23R ↻ ≫
DMBX1 ↻ ≫
EXOC2 ↻ ≫
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PPFIBP2 ↻ ≫
ARSG ↻ ≫
KDM8 ↻ ≫
RIMKLB ↻ ≫
KAZALD1 ↻ ≫
NCOA7 ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
RUNX1T1 ↻ ≫
CR1L ↻ ≫
PRDM12 ↻ ≫
KMT2A ↻ ≫
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NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
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TBX3 ↻ ≫
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OTX1 ↻ ≫
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MRPL34 ↻ ≫
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EVA1A ↻ ≫
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INAFM2 ↻ ≫
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IER3 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
NEK3 ↻ ≫
FGR ↻ ≫
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PYDC5 ↻ ≫
TCF7L2 ↻ ≫
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MBD2 ↻ ≫
TMPPE ↻ ≫
METTL3 ↻ ≫
GLB1 ↻ ≫
SPCS1 ↻ ≫
GLT8D1 ↻ ≫
CBX4 ↻ ≫
FKBP1A ↻ ≫
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DBX1 ↻ ≫
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PDP2 ↻ ≫
AXDND1 ↻ ≫
UPF3A ↻ ≫
SCGB1A1 ↻ ≫
TMEM14A ↻ ≫
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SULF1 ↻ ≫
OR10AC1 ↻ ≫
ABLIM3 ↻ ≫
CS ↻ ≫
PSMB5 ↻ ≫
LYL1 ↻ ≫
MVB12A ↻ ≫
METTL11B ↻ ≫
C5orf63 ↻ ≫
CACNA1D ↻ ≫
HIP1 ↻ ≫
PRDM6 ↻ ≫
SPG7 ↻ ≫
VOPP1 ↻ ≫
HNRNPA2B1 ↻ ≫
CBX3 ↻ ≫
HUS1 ↻ ≫
HEXIM2 ↻ ≫
KDM6B ↻ ≫
CMTM7 ↻ ≫
GTF3A ↻ ≫
ETFBKMT ↻ ≫
PANK4 ↻ ≫
HES5 ↻ ≫
LIN28A ↻ ≫
ARID5A ↻ ≫
TESC ↻ ≫
MAGEA11 ↻ ≫
RPS10-NUDT3 ↻ ≫
RPS10 ↻ ≫
NELFA ↻ ≫
NEO1 ↻ ≫
SEC14L1 ↻ ≫
TMEM212 ↻ ≫
ZFHX3 ↻ ≫
EAPP ↻ ≫
KCNAB2 ↻ ≫
JAK3 ↻ ≫
STK38 ↻ ≫
MYBPC3 ↻ ≫
NUTM2D ↻ ≫
FBXL18 ↻ ≫
MRS2 ↻ ≫
PARK7 ↻ ≫
CADM3 ↻ ≫
HSPA1L ↻ ≫
HSPA1A ↻ ≫
VIP ↻ ≫
TBC1D10C ↻ ≫
PPP1CA ↻ ≫
PHC2 ↻ ≫
TIGD1 ↻ ≫
EIF4E2 ↻ ≫
CCPG1 ↻ ≫
C15orf65 ↻ ≫
RPS6KA1 ↻ ≫
NOXO1 ↻ ≫
TDG ↻ ≫
SMC6 ↻ ≫
GEN1 ↻ ≫
C12orf73 ↻ ≫
SRSF11 ↻ ≫
LRRC40 ↻ ≫
FRAT2 ↻ ≫
C11orf24 ↻ ≫
SASH3 ↻ ≫
NRROS ↻ ≫
EMP3 ↻ ≫
RAI14 ↻ ≫
NR1D1 ↻ ≫
KAT6B ↻ ≫
HNRNPD ↻ ≫
PNKD ↻ ≫
KMT2E ↻ ≫
ATG16L2 ↻ ≫
KIF21B ↻ ≫
POR ↻ ≫
RPS24 ↻ ≫
POLR3A ↻ ≫
HOXD4 ↻ ≫
UBXN10 ↻ ≫
RASL12 ↻ ≫
PLA2G2C ↻ ≫
KBTBD13 ↻ ≫
GRHL3 ↻ ≫
LYPD1 ↻ ≫
KDM3A ↻ ≫
PRDM10 ↻ ≫
PAX8 ↻ ≫
SLCO4C1 ↻ ≫
MBNL3 ↻ ≫
TAF12 ↻ ≫
CCDC88A ↻ ≫
SNX1 ↻ ≫
CIAO2A ↻ ≫
RASA4 ↻ ≫
SLC7A5 ↻ ≫
TBC1D8 ↻ ≫
SPECC1 ↻ ≫
ARHGEF10L ↻ ≫
NADK ↻ ≫
ERCC1 ↻ ≫
ACTB ↻ ≫
CATSPERG ↻ ≫
BRWD1 ↻ ≫
IER3IP1 ↻ ≫
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CARNS1 ↻ ≫
LMO4 ↻ ≫
DGKZ ↻ ≫
SNCG ↻ ≫
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NELFE ↻ ≫
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FAM110A ↻ ≫
MEOX1 ↻ ≫
RASA4B ↻ ≫
ADM ↻ ≫
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REV3L ↻ ≫
TMEM104 ↻ ≫
NAT9 ↻ ≫
SHOX2 ↻ ≫
RSRC1 ↻ ≫
MTMR4 ↻ ≫
ATP23 ↻ ≫
CAND1 ↻ ≫
TBL2 ↻ ≫
STIL ↻ ≫
SMURF1 ↻ ≫
OTUD7B ↻ ≫
CRYAA ↻ ≫
CRYAA2 ↻ ≫
DIAPH1 ↻ ≫
ZNF76 ↻ ≫
CCDC114 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
USP15 ↻ ≫
CAMTA1 ↻ ≫
CCDC102A ↻ ≫
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RXRB ↻ ≫
HSD17B8 ↻ ≫
PLEC ↻ ≫
WNT10B ↻ ≫
SNX3 ↻ ≫
NEK7 ↻ ≫
ING1 ↻ ≫
CARS2 ↻ ≫
LRRN4 ↻ ≫
TRAF4 ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
MEF2D ↻ ≫
ASB6 ↻ ≫
AHNAK ↻ ≫
VAV1 ↻ ≫
SH2D3A ↻ ≫
GSTT4 ↻ ≫
CABIN1 ↻ ≫
MXI1 ↻ ≫
SOX21 ↻ ≫
NRXN2 ↻ ≫
HOXC8 ↻ ≫
RASSF5 ↻ ≫
LPCAT3 ↻ ≫
LNPEP ↻ ≫
BHLHE40 ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
RARG ↻ ≫
IMPG1 ↻ ≫
ZNF740 ↻ ≫
CSAD ↻ ≫
CPSF4L ↻ ≫
NEBL ↻ ≫
LIG3 ↻ ≫
DDX3X ↻ ≫
DENND2D ↻ ≫
PPP1R18 ↻ ≫
NRM ↻ ≫
CDC42EP3 ↻ ≫
ZNF367 ↻ ≫
IRX5 ↻ ≫
CCDC174 ↻ ≫
DIAPH3 ↻ ≫
GGCT ↻ ≫
IQCH ↻ ≫
AAGAB ↻ ≫
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RPL17 ↻ ≫
REC8 ↻ ≫
NFKBIA ↻ ≫
CCKAR ↻ ≫
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CBFA2T3 ↻ ≫
ZCCHC3 ↻ ≫
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MNT ↻ ≫
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ZDHHC1 ↻ ≫
DMD ↻ ≫
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BCL3 ↻ ≫
BNC2 ↻ ≫
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ZNF414 ↻ ≫
HOXB5 ↻ ≫
CPVL ↻ ≫
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SKI ↻ ≫
INAVA ↻ ≫
CNOT2 ↻ ≫
TRERF1 ↻ ≫
RAC2 ↻ ≫
DTX4 ↻ ≫
ZNF718 ↻ ≫
ZNF595 ↻ ≫
CMTR1 ↻ ≫
TTC13 ↻ ≫
ARV1 ↻ ≫
PCNA ↻ ≫
CDS2 ↻ ≫
TUBA1C ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
TUBB ↻ ≫
MDC1 ↻ ≫
IQGAP2 ↻ ≫
KHDRBS1 ↻ ≫
LFNG ↻ ≫
SPACA1 ↻ ≫
SUPT4H1 ↻ ≫
SLC38A10 ↻ ≫
LRIG1 ↻ ≫
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ADAT3 ↻ ≫
RXRA ↻ ≫
TYRO3 ↻ ≫
NDRG1 ↻ ≫
MYO1G ↻ ≫
NTRK2 ↻ ≫
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LOC102724265 ↻ ≫
CLDN2 ↻ ≫
RNASEH2B ↻ ≫
TPST2 ↻ ≫
CREB5 ↻ ≫
GPAA1 ↻ ≫
EXOSC4 ↻ ≫
MYO1B ↻ ≫
PPIB ↻ ≫
MINDY2 ↻ ≫
PTK2B ↻ ≫
DCSTAMP ↻ ≫
H6PD ↻ ≫
SLC9A1 ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
FTL ↻ ≫
DISP2 ↻ ≫
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H2BU1 ↻ ≫
H2AW ↻ ≫
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NAA10 ↻ ≫
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PKM ↻ ≫
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PCTP ↻ ≫
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CFD ↻ ≫
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MRPS24 ↻ ≫
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