データのメタデータ検索
全 696 件 (586件から590件)
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| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ詳細 |
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| 複合体モデリング | SAHG | 10.18908/lsdba.nbdc01193-003 |
各タンパク質の（複数のサブユニットからなる）複合体とそのモデリング情報（予測） |
タンパク質のアミノ酸配列をクエリにPQSデータベースにBlastで配列検索し、類似度80%以上の鋳型検出、アラインメント作成、Modellerによる立体構造モデリングを実施した。 |
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データ詳細
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| 複合体モデル構造 | SAHG | 10.18908/lsdba.nbdc01193-007 |
各複合体の予測されたモデル構造（PDB形式） |
タンパク質のアミノ酸配列をクエリにPQSデータベースにBlastで配列検索し、類似度80%以上の鋳型検出、アラインメント作成、Modellerによる立体構造モデリングを実施した。 |
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データ詳細
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| 配列アライメント | SAHG | 10.18908/lsdba.nbdc01193-004 |
モデリング対象配列と鋳型配列とのアライメント |
RefSeqの全長配列を専用パイプラインに入力して、立体構造を予測する際にアラインメント生成。予測パイプラインの詳細は文献参照（Motono et al., Nucleic Acids Research, 2011, 39, D487–D493）。 |
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データ詳細
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| Alternative products | SEVENS | 10.18908/lsdba.nbdc00681-001 |
Swiss-Protに登録されているalternative products（同一遺伝子由来だがalternative splicingなどにより配列が異なるたんぱく質）の情報を格納しています |
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データ詳細
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| Amino acid frequency | SEVENS | 10.18908/lsdba.nbdc00681-010 |
タンパク質中のアミノ酸出現頻度と、疎水性値を格納しています。 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データ取得方法 | 解析方法 | データ詳細 |