複合体モデリング

データ名

複合体モデリング

DOI

データ内容の説明

各タンパク質の（複数のサブユニットからなる）複合体とそのモデリング情報（予測）

データファイル

データファイル名:

sahg_complex.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

147 KB

簡易検索URL

データ取得方法

タンパク質のアミノ酸配列をクエリにPQSデータベースにBlastで配列検索し、類似度80%以上の鋳型検出、アラインメント作成、Modellerによる立体構造モデリングを実施した。

解析方法

データ件数

8,667 件

項目名	項目の説明
RefSeqID	RefSeq ID
Link to Protein	（簡易検索ページのみ）同一RefSeqIDのタンパク質基本情報へのリンク
regionFrom	複合体予測された領域の先頭アミノ酸残基
regionTo	複合体予測された領域の末尾アミノ酸残基
model PDB	（簡易検索ページのみ）モデル構造（PDB形式）へのリンク
Oligomer	複合体の種類（ホモ／ヘテロオリゴマー）
Model	同一タンパク質におけるモデル番号（連番）
Template	複合体の鋳型
Partner ID	複合体を形成する他のタンパク質のRefSeq ID

このデータベースについて