配列アライメント

データ名

配列アライメント

DOI

データ内容の説明

モデリング対象配列と鋳型配列とのアライメント

データファイル

データファイル名:

sahg_alignment.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

12.0 MB

簡易検索URL

データ取得方法

RefSeqの全長配列を専用パイプラインに入力して、立体構造を予測する際にアラインメント生成。予測パイプラインの詳細は文献参照（Motono et al., Nucleic Acids Research, 2011, 39, D487–D493）。

解析方法

データ件数

46,664 件

項目名	項目の説明
RefSeqID	RefSeq ID
Domain_type	ドメイン構造のタイプ（apoまたはholo）
Template	鋳型タンパク質名
Query_from	ターゲットタンパク質のアラインされた領域の先頭残基番号
Query_to	ターゲットタンパク質のアラインされた領域の末尾残基番号
Query_alignment	ターゲットタンパク質のアライメント配列
Template_from	鋳型タンパク質のアラインされた領域の先頭残基番号
Template_to	鋳型タンパク質のアラインされた領域の末尾残基番号
Template_alignment	鋳型タンパク質のアライメント配列
Alignment_line	アライメントのライン
Identity(%)	配列一致度

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