SAHG
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | |
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サーグ |
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Structure Atlas of Human Genome |
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10.18908/lsdba.nbdc01193-000 |
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本野 千恵
Tel : 03-3599-8067
E-mail : |
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タンパク質配列データベース-タンパク質属性
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ヒトゲノム由来の全タンパク質配列約24,900個に、配列から立体構造を予測し分子機能を類推する「構造・機能アノテーションシステム」を適用して、42,577個の構造モデルを予測し、結果をデータベースにまとめた。 |
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SAHGのタンパク質立体構造モデルは、高等生物由来のタンパク質に適した高精度の立体構造予測手法で生成された。またタンパク質の立体構造変化をモーフィングにより動画表示し、相互作用部位予測やリガンド結合予測結果と併せて表示することで、構造・運動・機能の実現を分りやすく可視化している。併せて、リガンド結合、複合体構造、膜貫通領域、酵素活性部位、天然変性領域等の予測情報も、視覚的に表示した。 |
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CC 表示-継承 詳細 |
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文献名
SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins
著者名
Chie Motono, Junichi Nakata, Ryotaro Koike, Kana Shimizu, Matsuyuki Shirota, Takayuki Amemiya, Kentaro Tomii, Nozomi Nagano, Naofumi Sakaya, Kiyotaka Misoo, Miwa Sato, Akinori Kidera, Hidekazu Hiroaki, Tsuyoshi Shirai, Kengo Kinoshita, Tamotsu Noguchi, Motonori Ota
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Research, 2011, Vol. 39,
外部リンク
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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* オリジナルサイトでの公開を終了 |
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(運用終了) http://bird.cbrc.jp/sahg |
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2009/10 |
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2010/6/25 |
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RefSeq, HPRD, EzCatDB, InterPro, UniProtKB/Swiss-Prot |
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有り |
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有り |
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無し |




