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SAHG
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
SAHG
名称の読み方
サーグ
別名
Structure Atlas of Human Genome
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01193-000
作成者
作成氏名
本野 千恵*
作成者英名
Motono Chie
作成者所属
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
作成者の文献検索
作成氏名
太田 元規
作成者英名
Ota Motonori
作成者所属
名古屋大学 大学院情報科学研究科
作成者の文献検索
連絡先
本野 千恵 Tel : 03-3599-8067 E-mail : sahg address
データベース分類

タンパク質配列データベース-タンパク質属性
構造データベース-タンパク質構造
ヒト/その他の脊椎動物ゲノム-ヒトORF

生物種
Taxonomy Name
Homo sapiens
Taxonomy ID
データベースの説明

ヒトゲノム由来の全タンパク質配列約24,900個に、配列から立体構造を予測し分子機能を類推する「構造・機能アノテーションシステム」を適用して、42,577個の構造モデルを予測し、結果をデータベースにまとめた。

データベースの特長・有用性・活用方法

SAHGのタンパク質立体構造モデルは、高等生物由来のタンパク質に適した高精度の立体構造予測手法で生成された。またタンパク質の立体構造変化をモーフィングにより動画表示し、相互作用部位予測やリガンド結合予測結果と併せて表示することで、構造・運動・機能の実現を分りやすく可視化している。併せて、リガンド結合、複合体構造、膜貫通領域、酵素活性部位、天然変性領域等の予測情報も、視覚的に表示した。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
科学技術振興機構バイオインフォマティクス推進センター事業
論文等
文献名
SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins
著者名
Chie Motono, Junichi Nakata, Ryotaro Koike, Kana Shimizu, Matsuyuki Shirota, Takayuki Amemiya, Kentaro Tomii, Nozomi Nagano, Naofumi Sakaya, Kiyotaka Misoo, Miwa Sato, Akinori Kidera, Hidekazu Hiroaki, Tsuyoshi Shirai, Kengo Kinoshita, Tamotsu Noguchi, Motonori Ota
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Research, 2011, Vol. 39,
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
(運用終了) http://bird.cbrc.jp/sahg
運用開始年月日
2009/10
最終更新年月日
2010/6/25
統括サイト
-
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース

RefSeq, HPRD, EzCatDB, InterPro, UniProtKB/Swiss-Prot

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