データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ACC2ID | PGE | 10.18908/lsdba.nbdc00777-003 |
独自に付与した配列IDと国際塩基配列データバンクに登録した際に付与された配列IDとの対応表 |
pge_acc2id.zip
(76KB) |
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- |
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23,155件 |
データ詳細
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| IDINFO | PGE | 10.18908/lsdba.nbdc00777-001 |
基本テーブル |
pge_idinfo.zip
(3.5MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/pge_idinfo |
シーケンサー |
ゲノムマッピング
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23155件 |
データ詳細
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| MARKER | PGE | 10.18908/lsdba.nbdc00777-002 |
染色体別の発現プロファイル |
pge_marker.zip
(6KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/pge_marker |
シーケンサー |
ゲノムマッピング
|
787件 |
データ詳細
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| FACS-based single-cell PCRデータ | Plabrain DB | 10.18908/lsdba.nbdc01108-001 |
FACS-based single-cell PCRを用いた細胞ごとの遺伝子発現パターン。各遺伝子を発現している細胞を表す"＋"のパターンから、同じ神経系で発現していることが知られる遺伝子であっても、単一ニューロンでは発現パターンに違いがあることが分かる。 データには同情報をFACSプロファイル上にマップした結果の画像ファイル名も含まれる。 画像ファイル自体は 「PCRデータをマップしたFACSプロファイル画像」のデータファイルから一括ダウンロードが可能である。 |
planaria_fbsc_pcr.zip
(1KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/plabrain_single_cell_exp#ja |
FBSC-PCR （FACSを用いた半定量的single-cell PCR） |
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12件 |
データ詳細
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| in situ hybridizationと組織免疫染色の顕微鏡画像ファイル | Plabrain DB | 10.18908/lsdba.nbdc01108-004 |
プラナリア成体のWhole-mount in situ hybridizationによる遺伝子の発現部位の画像、および頭部の再生段階ごとの組織免疫染色による蛋白質の局在画像のファイル。
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planaria_image.zip
(2.74MB) |
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Whole-mount in situ hybridization、組織免疫染色 |
- |
35件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |