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PGE
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
PGE
名称の読み方
ピージーイー
別名
Gene Expression Pattern Database of Mouse Embryos
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00777-000
作成者
作成氏名
ERATO土居バイオアシンメトリプロジェクト、独立行政法人 科学技術振興機構 *
作成者英名
ERATO Doi Bioasymmetry Project, Japan Science and Technology Agency
作成者所属
連絡先

E-mail: pge_address

データベース分類

塩基配列データベース-コーディング/ノンコーディング領域DNA
マイクロアレイデータ、その他の発現データのデータベース

生物種
Taxonomy Name
Mus musculus
Taxonomy ID
データベースの説明

マウスの初期発生で発現している約25000個のcDNAの塩基配列(部分)を決定し、胚の体軸形成に関与すると考えられる遺伝子や約4000の新規遺伝子を見い出した。その際、得られたEST配列と初期発生段階である未受精卵、受精卵、2細胞期、4細胞期、8細胞期、16細胞期、32および64細胞期(blastocyst)の発現をデータベースとしている。

データベースの特長・有用性・活用方法

マウス胚の遺伝子発現パターンを発生段階を追って参照することができる。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
(独)科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業(総括実施型研究)(創造科学技術推進事業)土居バイオアシンメトリプロジェクト(1995年10月-2000年9月):生命における非対称性を指標にして、様々な生物種で、各種の生命現象を解析。
論文等
文献名
Large-scale cDNA analysis reveals phased gene expression patterns during preimplantation mouse development
著者名
Ko MS, Kitchen JR, Wang X, Threat TA, Wang X, Hasegawa A, Sun T, Grahovac MJ, Kargul GJ, Lim MK, Cui Y, Sano Y, Tanaka T, Liang Y, Mason S, Paonessa PD, Sauls AD, DePalma GE, Sharara R, Rowe LB, Eppig J, Morrell C, Doi H.
雑誌名/掲載年月/号
Development. 2000 Apr;127(8):1737-49
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所

独立行政法人 科学技術振興機構
※オリジナルサイトでの公開を終了

オリジナルサイト
-
運用開始年月日
2000
最終更新年月日
2000
統括サイト
http://www-bird.jst.go.jp/database/bird/
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース
一覧表示
有り
クエリ検索
有り
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し