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生命科学系データベースアーカイブ

Plabrain DB

FACS-based single-cell PCRデータ

データ説明

info データ名 FACS-based single-cell PCRデータ
info DOI 
info データ内容の説明 

FACS-based single-cell PCRを用いた細胞ごとの遺伝子発現パターン。各遺伝子を発現している細胞を表す"＋"のパターンから、同じ神経系で発現していることが知られる遺伝子であっても、単一ニューロンでは発現パターンに違いがあることが分かる。 データには同情報をFACSプロファイル上にマップした結果の画像ファイル名も含まれる。 画像ファイル自体は 「PCRデータをマップしたFACSプロファイル画像」のデータファイルから一括ダウンロードが可能である。

info データファイル 
データファイル名:
planaria_fbsc_pcr.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/plabrain-db/LATEST/planaria_fbsc_pcr.zip
ファイルサイズ:
1KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

FBSC-PCR （FACSを用いた半定量的single-cell PCR）

info 解析方法 

-

info データ件数 

12件

データ詳細

項目名項目の説明
Gene name (Link to Image list) 遺伝子名。簡易検索では画像リストへの内部リンク。
Single-cell PCR data (+ describes cells expressing the gene.) 全神経発現マーカーEF1と各遺伝子を発現する細胞を"＋"で示す。
Mapping on FACS profile FACSプロファイル画像のファイル名。DNA量 (縦軸 Hoechst33342)と細胞サイズ (横軸 CalceinAM)によりcell sortingをしたFACSプロファイルに、PCRデータをマップしている（"＋"の細胞を青色のドットで表している）。簡易検索では"FACS Profile"ボタンを押すと、画像が表示される。