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このデータベースについて

FACS-based single-cell PCRデータ

データ説明
データ名
FACS-based single-cell PCRデータ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01108-001
データ内容の説明
FACS-based single-cell PCRを用いた細胞ごとの遺伝子発現パターン。各遺伝子を発現している細胞を表す"+"のパターンから、同じ神経系で発現していることが知られる遺伝子であっても、単一ニューロンでは発現パターンに違いがあることが分かる。 データには同情報をFACSプロファイル上にマップした結果の画像ファイル名も含まれる。 画像ファイル自体は <a href="jp/plabrain-db/data-2.html">「PCRデータをマップしたFACSプロファイル画像」のデータファイル</a>から一括ダウンロードが可能である。
データファイル
データファイル名 :
planaria_fbsc_pcr.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
1KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/plabrain_single_cell_exp#ja
データ取得方法

FBSC-PCR (FACSを用いた半定量的single-cell PCR)

解析方法

-

データ件数

12件

データ詳細
項目名 項目の説明
Gene name (Link to Image list)

遺伝子名。簡易検索では画像リストへの内部リンク。

Single-cell PCR data (+ describes cells expressing the gene.)

全神経発現マーカーEF1と各遺伝子を発現する細胞を"+"で示す。

Mapping on FACS profile

FACSプロファイル画像のファイル名。DNA量 (縦軸 Hoechst33342)と細胞サイズ (横軸 CalceinAM)によりcell sortingをしたFACSプロファイルに、PCRデータをマップしている("+"の細胞を青色のドットで表している)。簡易検索では"FACS Profile"ボタンを押すと、画像が表示される。