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生命科学系データベースアーカイブ

PGE

IDINFO

データ説明

info データ名 IDINFO
info DOI 
info データ内容の説明 

基本テーブル

info データファイル 
データファイル名:
pge_idinfo.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/pge/LATEST/pge_idinfo.zip
ファイルサイズ:
3.5MB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

シーケンサー

info 解析方法 

ゲノムマッピング
機能アノテーション

info データ件数 

23155件

データ詳細

項目名主キー外部キー項目の説明
SEQ_ID

check

check

 独自に付与した配列ID。テーブル名AA2IDのSEQ_ID
CLUSTER_ID  

check

 cluster ID of EST sequences。テーブル名MARKERのCLUSTER_ID
DEV_STAGE     初期胚の発生段階
CLONE_ID     clone ID
ACCESSION  

check

 国際塩基配列データバンクのaccession_id。テーブル名ACC2IDのACCESSION
DESCRIPTION     説明、国際塩基配列データバンクのDEFINITION
SEQ_LENGTH     塩基配列の長さ、塩基数
BASE_N     塩基として判別できなかった塩基数
SEQUENCE     塩基配列