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データのメタデータ一覧
全 696 件 (256件から260件)
件を表示 詳細検索
データ名 データベース名 DOI 説明 データファイル 簡易検索URL データ取得方法 解析方法 データ件数 データ詳細
HIPデータセット H-InvDB 10.18908/lsdba.nbdc00092-004

タンパク質のアノテーションデータ

FPROTEIN.gz
(310 MB)
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152,151 件
データ詳細 open_in_full
クラスターデータセット H-InvDB 10.18908/lsdba.nbdc00092-002

遺伝子座のアノテーションデータ

FLOCUS.gz
(51.4 MB)
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45,847 件
データ詳細 open_in_full
モチーフ HATODAS 10.18908/lsdba.nbdc00490-002.V002

重原子とその重原子が頻繁に結合するアミノ酸配列モチーフの対のリスト。それぞれの対に対して、その根拠となった事例と実際の配列を示すために、 オリジナルHATODAS内へのリンクの情報が付随している。 ※なおダウンロードファイルでは、「atom」、「motif」は7列(理研サイネスでのクラスID、クラス名、インスタンスID、インスタンス名、 URI、インスタンスのライセンス、インスタンスのアトリビューション)で表現されている

hatodas_motif.zip
(788 bytes)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/hatodas_motif

PDBより取得、モチーフに関する文献情報を追加

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重原子とモチーフの対101件(重原子8種、モチーフ89種)
データ詳細 open_in_full
重原子レコード HATODAS 10.18908/lsdba.nbdc00490-001.V002

重原子導入事例のリスト。 なおダウンロードファイルでは、各項目は7列(理研サイネスでのクラスID、クラス名、インスタンスID、 インスタンス名、URI、インスタンスのライセンス、インスタンスのアトリビューション)で表現されている。

hatodas.zip
(62.2 KB)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/hatodas_db

PDBより取得

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3,169件
データ詳細 open_in_full
日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度 Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population 10.18908/lsdba.nbdc00171-001

Kong A et al. Nat. Genet. 2002 Jul;31(3):241-7.に記載された4,868マイクロサテライトマーカーについて,日本人32検体の遺伝子型を取得し,アレル頻度よりヘテロ接合度を算出した。

heterozygosity_jp.zip
(113KB)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/heterozygosity_jp

キャピラリーシーケンサー

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5,037件
データ詳細 open_in_full
データ名 データベース名 DOI 説明 データファイル 簡易検索URL データ取得方法 解析方法 データ件数 データ詳細