データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HIPデータセット | H-InvDB | 10.18908/lsdba.nbdc00092-004 |
タンパク質のアノテーションデータ |
FPROTEIN.gz
(310 MB) |
- | 152,151 件 |
データ詳細
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| クラスターデータセット | H-InvDB | 10.18908/lsdba.nbdc00092-002 |
遺伝子座のアノテーションデータ |
FLOCUS.gz
(51.4 MB) |
- | 45,847 件 |
データ詳細
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| モチーフ | HATODAS | 10.18908/lsdba.nbdc00490-002.V002 |
重原子とその重原子が頻繁に結合するアミノ酸配列モチーフの対のリスト。それぞれの対に対して、その根拠となった事例と実際の配列を示すために、 オリジナルHATODAS内へのリンクの情報が付随している。 ※なおダウンロードファイルでは、「atom」、「motif」は7列(理研サイネスでのクラスID、クラス名、インスタンスID、インスタンス名、 URI、インスタンスのライセンス、インスタンスのアトリビューション)で表現されている |
hatodas_motif.zip
(788 bytes) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/hatodas_motif |
PDBより取得、モチーフに関する文献情報を追加 |
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重原子とモチーフの対101件(重原子8種、モチーフ89種) |
データ詳細
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| 重原子レコード | HATODAS | 10.18908/lsdba.nbdc00490-001.V002 |
重原子導入事例のリスト。 なおダウンロードファイルでは、各項目は7列(理研サイネスでのクラスID、クラス名、インスタンスID、 インスタンス名、URI、インスタンスのライセンス、インスタンスのアトリビューション)で表現されている。 |
hatodas.zip
(62.2 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/hatodas_db |
PDBより取得 |
- |
3,169件 |
データ詳細
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| 日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度 | Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population | 10.18908/lsdba.nbdc00171-001 |
Kong A et al. Nat. Genet. 2002 Jul;31(3):241-7.に記載された4,868マイクロサテライトマーカーについて,日本人32検体の遺伝子型を取得し,アレル頻度よりヘテロ接合度を算出した。 |
heterozygosity_jp.zip
(113KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/heterozygosity_jp |
キャピラリーシーケンサー |
- |
5,037件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |