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このデータベースについて

モチーフ

データ説明
データ名
モチーフ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00490-002.V002
バージョン
V2 10.18908/lsdba.nbdc00490-002.V002 更新履歴
V1 10.18908/lsdba.nbdc00490-002.V001 -
データ内容の説明
重原子とその重原子が頻繁に結合するアミノ酸配列モチーフの対のリスト。それぞれの対に対して、その根拠となった事例と実際の配列を示すために、 オリジナルHATODAS内へのリンクの情報が付随している。 ※なおダウンロードファイルでは、「atom」、「motif」は7列(理研サイネスでのクラスID、クラス名、インスタンスID、インスタンス名、 URI、インスタンスのライセンス、インスタンスのアトリビューション)で表現されている
データファイル
データファイル名 :
hatodas_motif.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
788 bytes
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/hatodas_motif
データ取得方法

PDBより取得、モチーフに関する文献情報を追加

解析方法

-

データ件数

重原子とモチーフの対101件(重原子8種、モチーフ89種)

データ詳細
項目名 項目の説明
Atom

重原子(導入された重原子)

Atom name

重原子の名称

Motif

モチーフ(重原子が頻繁に導入されたアミノ酸配列のパターン)

Examples in HATODAS

オリジナルHATODAS内のこのモチーフと重原子のペア