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日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度

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Kong A et al. Nat. Genet. 2002 Jul;31(3):241-7.に記載された4,868マイクロサテライトマーカーについて，日本人32検体の遺伝子型を取得し，アレル頻度よりヘテロ接合度を算出した。

データファイル

データファイル名 :

heterozygosity_jp.zip

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ファイルサイズ :

113KB

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データ取得方法

キャピラリーシーケンサー

解析方法

データ件数

5,037件

データ詳細

項目名	項目の説明
Marker name	マーカー名。　簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。
Marker name (Also known as)	マーカー名 (別称)。簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。
Chromosome	染色体の番号
Position	染色体上の位置
Position (bp) UCSC 2006 Mar, 2004 Jul, 2003 May*	UCSCによる染色体上の位置 (bp) は2004 Jul.、*は2003 May、それ以外は2006 Mar.のバージョン。
No. of Alleles (observed)	アレル数
Het	ヘテロ接合度
Position (cM) Genethon	Genethon社による染色体上の位置 (cM)
Position (cM) Marshfield	Marshfield社による染色体上の位置 (cM)
Position (cM) deCODE	deCODE Genetics社による染色体上の位置 (cM)
Repeat Unit	リピート長
Gene (markers in intron or UTR)	遺伝子記号 (イントロンもしくはUTRにマーカーが存在する場合)
Linkage set	連鎖解析のために選ばれたマーカーに＊を付与している。