このデータベースについて

重原子レコード

データ説明

データ名

重原子レコード

DOI

バージョン

V2	10.18908/lsdba.nbdc00490-001.V002	更新履歴
V1	10.18908/lsdba.nbdc00490-001.V001	-

データ内容の説明

重原子導入事例のリスト。なおダウンロードファイルでは、各項目は７列（理研サイネスでのクラスID、クラス名、インスタンスID、インスタンス名、URI、インスタンスのライセンス、インスタンスのアトリビューション）で表現されている。

データファイル

データファイル名 :

hatodas.zip

データのURL :

ファイルサイズ :

62.2 KB

簡易検索URL

データ取得方法

PDBより取得

解析方法

データ件数

3,169件

データ詳細

項目名	項目の説明
RIKEN Heavy Atom Record	理研重原子レコード（重原子導入事例）基本ID
Version	重原子レコードのバージョン
Site	重原子結合サイト（重原子が結合したアミノ酸残基種）
Protein	タンパク質（重原子が導入されたタンパク質）
PDB ID	タンパク質のPDB ID
PDB Reference URL	タンパク質情報の説明ページ(PDB)のURL
UniProt ID	タンパク質のUniProt ID
Atom	重原子（導入された重原子）
Heavy atom compound	重原子化合物（重原子の導入に使われた化合物）
Heavy atom compound ontology	重原子化合物のオントロジー
Insert method	重原子化実験方法（重原子を導入した方法）
Heavy atom concentration	導入時の重原子の濃度(mM)
Precipitant	沈殿剤（結晶化に用いられた沈殿剤）
Precipitant ontology	沈殿剤のオントロジー
Buffer solution	緩衝液（結晶化に用いられた緩衝液）
Buffer solution ontology	緩衝液のオントロジー
Buffer concentration	結晶化に用いられた緩衝液の濃度(mM)
Buffer pH	結晶化に用いられた緩衝液のpH
Soaking time	重原子導入時間 (hour)
Back-soaking time	バックソーキング時間 (hour)
Reference	文献（雑誌名・巻・頁・年）
Reference URL	文献のURL