データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
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H-InvDB
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名称の読み方
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エイチインブディービー |
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別名
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H-Invitational Database |
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00092-000 |
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作成者
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作成氏名
今西 規   
作成者英名
Tadashi Imanishi
作成者所属
東海大学 医学部
作成者の文献検索
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連絡先
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〒259-1193 神奈川県伊勢原市下糟屋143
東海大学伊勢原キャンパス 医学部1号館7階
E-mail: 
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データベース分類
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塩基配列データベース-遺伝子構造、イントロン/エクソン、スプライス部位 |
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生物種
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データベースの説明
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H-InvDBはヒトのすべての転写産物を対象とした統合データベースです。ヒト遺伝子の構造、選択的スプライシングバリアント、機能性RNA、タンパク質としての機能、機能ドメイン、細胞内局在、代謝経路、立体構造、疾病との関連、遺伝子多型（SNP、マイクロサテライト等）、 遺伝子発現プロファイル、分子進化学的特徴、タンパク質間相互作用(PPI)、遺伝子ファミリー などの精査されたアノテーション（注釈付け）情報を提供しています。
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データベースの特長・有用性・活用方法
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タンパク質コード遺伝子座（遺伝子）をタンパク質存在の信頼度に従って、カテゴリ化しています。目的に応じて遺伝子セットを選択して解析できます。
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データベースの利用許諾
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CC 表示-継承 詳細 |
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予算的背景・プロジェクト
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名称
バイオインフォマティクス関連データベース整備(平成12年度-16年度) 
名称
ゲノム情報統合プロジェクト(平成17年度-19年度)
名称
統合データベースプロジェクト(平成20年度-22年度)
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論文等
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文献名
H-InvDB in 2009: extended database and data mining resources for human genes and transcripts.
著者名
Yamasaki C, et al.
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Research, 2010, Jan;38 (Database issue): D626-32.
外部リンク
文献名
The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts.
著者名
Yamasaki C, et al.
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Research, 2008, 36, Database issue D793-D799.
外部リンク
文献名
H-InvDB in 2013: an omics study platform for human functional gene and transcript discovery.
著者名
Takeda J, et al.
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Research, 2013, Jan; 41 (Database issue): D915-9.
外部リンク
文献名
Integrative Annotation of 21,037 Human Genes Validated by Full-Length cDNA Clones.
著者名
T. Imanishi et al.
雑誌名/掲載年月/号
PLoS Biology (2004) 2 (6), 856-875.
外部リンク
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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データベース運用場所
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オリジナルサイト
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http://www.h-invitational.jp/hinv/ahg-db/index.jsp |
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運用開始年月日
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2004/04/20 |
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最終更新年月日
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2015/05/27 |
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統括サイト
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http://www.h-invitational.jp/ |
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データの一括ダウンロードサイト
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http://www.h-invitational.jp/hinv/dataset/download.cgi |
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参照先データベース
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CHGC , DKFZ/MIPS , IMSUT , KDRI , MGC/NCI , BIND , BodyMap , CCDS , dbSNP , DDBJ/EMBL/GenBank , DIP , Ensembl , EntrezGene , fRNAdb , GenAtlas , Gene ontology (GO) , GeneCards , GGDB , GTOP , HGNC , H-GOLD (GDBS) , HPRD , IntAct , InterPro , KEGG , LIFEdb , LSBM , MGI , MINT , Mutation view , NC-IUBMB (EC) , OMIM , PubMed , RefSeq , UCSC , UniGene , UniProt |
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一覧表示
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無し |
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クエリ検索
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有り |
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Webサービス
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有り |
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WebサービスURL
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http://www.h-invitational.jp/hinv/hws/doc/index.html |
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無し |