[クレジット]
閉じる



- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に！-

生命科学系データベースアーカイブ

H-InvDB

データベースの説明

データベース全般

info 名称 H-InvDB
info 名称の読み方 エイチインブディービー
info 別名 H-Invitational Database
info DOI 
info 作成者 
作成者氏名:
今西 規
作成者英名:
Tadashi Imanishi
作成者所属:
東海大学 医学部
作成者の文献検索:
info 連絡先 

〒259-1193 神奈川県伊勢原市下糟屋143

東海大学伊勢原キャンパス　医学部1号館7階

E-mail: h-inv address

info データベース分類 塩基配列データベース-遺伝子構造、イントロン/エクソン、スプライス部位
info 生物種 
生物種名:
Homo sapiens
Taxonomy ID:
info データベースの説明 

H-InvDBはヒトのすべての転写産物を対象とした統合データベースです。ヒト遺伝子の構造、選択的スプライシングバリアント、機能性RNA、タンパク質としての機能、機能ドメイン、細胞内局在、代謝経路、立体構造、疾病との関連、遺伝子多型（SNP、マイクロサテライト等）、 遺伝子発現プロファイル、分子進化学的特徴、タンパク質間相互作用(PPI)、遺伝子ファミリー などの精査されたアノテーション（注釈付け）情報を提供しています。

本アーカイブは、H-InvDB_8.3から作成しています。

info データベースの特長・有用性・活用方法 

タンパク質コード遺伝子座（遺伝子）をタンパク質存在の信頼度に従って、カテゴリ化しています。目的に応じて遺伝子セットを選択して解析できます。

統計情報のページ ( http://h-invitational.jp/hinv/ahg-db/statistics_ja.jsp )。

複合検索で絞込が可能です( http://h-invitational.jp/hinv/c-search/gotocrssearch.do?lang=ja )。

プログラムからアクセスできるようにWebサービスが使えます( http://h-invitational.jp/hinv/hws/doc/index_jp.html )。

info データベースの利用許諾 CC 表示-継承 詳細
info 予算的背景・プロジェクト 
名称:
バイオインフォマティクス関連データベース整備(平成12年度-16年度)
名称:
ゲノム情報統合プロジェクト(平成17年度-19年度)
名称:
統合データベースプロジェクト(平成20年度-22年度)
info 論文等 
文献名:
H-InvDB in 2013: an omics study platform for human functional gene and transcript discovery.
著者名:
Takeda J, et al.
雑誌名/掲載年月/号:
Nucleic Acids Research, 2013, Jan; 41 (Database issue): D915-9.
外部リンク:
 
文献名:
H-InvDB in 2009: extended database and data mining resources for human genes and transcripts.
著者名:
Yamasaki C, et al.
雑誌名/掲載年月/号:
Nucleic Acids Research, 2010, Jan;38 (Database issue): D626-32.
外部リンク:
 
文献名:
The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts.
著者名:
Yamasaki C, et al.
雑誌名/掲載年月/号:
Nucleic Acids Research, 2008, 36, Database issue D793-D799.
外部リンク:
 
文献名:
Integrative Annotation of 21,037 Human Genes Validated by Full-Length cDNA Clones.
著者名:
T. Imanishi et al.
雑誌名/掲載年月/号:
PLoS Biology (2004) 2 (6), 856-875.
外部リンク:
 

データベースのオリジナルサイト情報

info データベース運用場所 

info オリジナルサイト 
info 運用開始年月日 2004/04/20
info 最終更新年月日 2015/05/27
info 統括サイト 
info データの一括ダウンロードサイト 
info 参照先データベース 

CHGC , DKFZ/MIPS , IMSUT , KDRI , MGC/NCI , BIND , BodyMap , CCDS , dbSNP , DDBJ/EMBL/GenBank , DIP , Ensembl , EntrezGene , fRNAdb , GenAtlas , Gene ontology (GO) , GeneCards , GGDB , GTOP , HGNC , H-GOLD (GDBS) , HPRD , IntAct , InterPro , KEGG , LIFEdb , LSBM , MGI , MINT , Mutation view , NC-IUBMB (EC) , OMIM , PubMed , RefSeq , UCSC , UniGene , UniProt

info 一覧表示 無し
info クエリ検索 有り
info Webサービス 有り
info WebサービスURL 
info ユーザ登録 無し