データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
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| 配列データ | fRNAdb | 10.18908/lsdba.nbdc00452-003 |
機能性RNAの配列ファイル（FASTA形式）
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Sequence_Data
(102 MB) |
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文献および既存データベースからの収集による。 |
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14ファイル |
データ詳細
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| クラスタリングに使用したアミノ酸配列（マルチFASTA形式） | Gclust Server | 10.18908/lsdba.nbdc00464-004 |
９５生物種の予測されたタンパク質のアミノ酸配列、及びそれらのアノテーション。FASTA形式ファイル。 |
all95.fa.zip
(161MB) |
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データ詳細
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| クラスタリング結果 | Gclust Server | 10.18908/lsdba.nbdc00464-009 |
Gclustプログラムの実行結果。 プログラム実行時の条件、クラスターID、クラスター分けに使用された閾値、クラスターに属する配列ID、 関連グループの配列IDなどの情報が記載されている。 |
all95m8.hom.1.zip
(140MB) |
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データ詳細
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| クラスターと生物種数の表 | Gclust Server | 10.18908/lsdba.nbdc00464-010 |
クラスター、クラスターの代表配列ID、その長さ、クラスターに含まれる配列の数、生物種、 95の生物種毎のそのクラスターに属する配列数をタブ区切りテキストファイル形式にまとめた表。 |
all95.tbl.zip
(4.53MB) |
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データ詳細
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| クラスターと類似関係にあるアミノ酸配列のID | Gclust Server | 10.18908/lsdba.nbdc00464-003 |
９５生物種のタンパク質アミノ酸配列の各クラスターに対して類似性はあるが、クラスター形成には用いなかったタンパク質アミノ酸配列のID。CSV形式のテキス トファイル。 |
gclust_related.zip
(69MB) |
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本データベース中のアミノ酸配列データ |
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14,444,047件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |