| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| fRNAdbサマリ | fRNAdb | 10.18908/lsdba.nbdc00452-001 |
機能性RNAデータベースは、文献で報告された機能性RNAを収集し、塩基配列、ゲノム位置、2次構造、文献情報などと関連付けてカタログ化したものである。 |
frnadb_summary.zip
(46.5 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/frnadb_summary |
RNA情報は文献および既存データベースからの収集による。ゲノム位置、2次構造は計算機による予測による。文献情報は、RNAファミリ名を題名・要旨に含むものを検索したものである。 |
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510,055 件 |
データ詳細
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| RNA二次構造イメージ | fRNAdb | 10.18908/lsdba.nbdc00452-005 |
各エントリのRNA二次構造の画像データ
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RNA_secondary_structure_image
(9.6 GB) |
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「配列データ」より取得 |
RNAニ次構造予測ツールCentroidFoldによる予測結果（可能なもののみ）を利用している。 |
3ファイル （Zipファイル内の画像データは、それぞれ 338,167ファイル） |
データ詳細
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| データベースダンプ | fRNAdb | 10.18908/lsdba.nbdc00452-002 |
オリジナルサイトで公開されていたデータベースをダンプしたデータ
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Database_Dump
(673 MB) |
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RNA情報は文献および既存データベースからの収集による。ゲノム位置、2次構造は計算機による予測による。文献情報は、RNAファミリ名を題名・要旨に含むものを検索したものである。 |
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4ファイル |
データ詳細
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| マッピング情報 | fRNAdb | 10.18908/lsdba.nbdc00452-004 |
４生物種ゲノムに対するマッピング結果
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Mapping_Information
(120 MB) |
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12ファイル |
データ詳細
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| 補足データ | fRNAdb | 10.18908/lsdba.nbdc00452-006 |
・xref.zip：エントリのID、アクセション番号、マッピングされたゲノム上の位置（ヒトのみ）
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Supplementary_Data
(3.8 MB) |
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2ファイル |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |
データのメタデータ一覧