データベースの説明

データベース全般
名称	Gclust Server
名称の読み方	ジークラストサーバー
別名	-
DOI	10.18908/lsdba.nbdc00464-000
作成者	作成氏名佐藤直樹* 作成者英名 Naoki Sato 作成者所属東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻生命環境科学系
連絡先	東京大学大学院　総合文化研究科　広域科学専攻生命環境科学系佐藤　直樹 E-mail:
データベース分類	タンパク質配列データベース
データベースの説明	95生物種のタンパク質の総当たりBlast検索の結果得られたクラスタのデータベース
データベースの特長・有用性・活用方法	比較する全生物種の全タンパク質の総当たりBLASTの結果に基づいて，類似度の閾値を自動的に設定しながら，相同タンパク質の分類を行うのがGclustの特徴である。また，機能未知タンパク質についても相同クラスタができるため，注目する生物群に特有の相同クラスタを見つけることにより，それら生物群に固有の生理機能にかかわるタンパク質を発見する手がかりを与えることができる（系統プロファイリング）。 Gclustデータベースは系統プロファイルによる検索を可能にした相同タンパク質データベースである。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称文部科学省特定領域研究　ゲノム研究相同タンパク質を多数の生物について比較することは，比較ゲノム研究のもっとも基本となるところであるが，従来の方法では，ゲノムを１対１で比較したデータを集めるのが普通であった。タンパク質の種類によって，類似度には大きな差が有り，非常に保存性の高いタンパク質グループもあれば，かなり保存性が低いオルソログも存在する。こうした点を考慮しながら，ゲノム特定の公募研究として，自動的にオルソログクラスタを作る手法を開発し，光合成生物特有のタンパク質群の機能解析に応用した。
論文等	文献名 Gclust: trans-kingdom classification of proteins using automatic individual threshold setting. 著者名 Naoki Sato 雑誌名/掲載年月/号 Bioinformatics 2009 Mar 1;25(5):599-605. 外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	東京大学大学院　総合文化研究科　広域科学専攻生命環境科学系
オリジナルサイト	http://gclust.c.u-tokyo.ac.jp/
運用開始年月日	2006/6
最終更新年月日	2008/4
統括サイト	-
データの一括ダウンロードサイト	http://gclust.c.u-tokyo.ac.jp/Gclust_Download.html
参照先データベース	NCBI , JGI(http://www.jgi.doe.gov/) , CGP(http://merolae.biol.s.u-tokyo.ac.jp/)
一覧表示	無し
クエリ検索	有り
Webサービス	無し
WebサービスURL	-
ユーザ登録	無し