| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
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| マウス生殖系列のSBトランスポゾン挿入部位データ | Transposon insertion site database - germline | 10.18908/lsdba.nbdc00718-001 |
マウス生殖系列のSBトランスポゾン挿入部位データ。 トランスポゾン挿入マウス系統に関する実験関連情報(挿入位置に隣接する配列情報等)、挿入位置近傍の遺伝子に関する情報、及びトランスポゾン挿入位置に 関する情報をリストしている。 |
germline_sb_transposon.zip
(28KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/germline_sb_transposon |
Ligation-mediated PCR (LM-PCR) |
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259件 |
データ詳細
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| EST配列 | Trifolium pratense EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00782-002 |
ムラサキツメクサのEST配列データ。1配列につき1ファイルのFasta形式。 FASTA形式のヘッダ部分に、AccessionとClone IDが記述される。 データ件数は38,100件。 |
Red_clover_tfa.tar.gz
(7.2MB) |
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キャピラリーシーケンサー |
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38,100件 |
データ詳細
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| EST配列一覧 | Trifolium pratense EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00782-001 |
ムラサキツメクサのEST配列データの一覧。CSV形式のテキストファイル。 データ件数は38,100件。 |
kazusa_trifo_est.zip
(5.9MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kazusa_trifo_est |
キャピラリーシーケンサー |
- |
38,100件 |
データ詳細
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| tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ | tRNADB-CE | 10.18908/lsdba.nbdc00720-001 |
tRNAの探索結果、キュレーションのデータ。tRNA 遺伝子の探査は、3 種の予測プログラム(tRNAScan-SE, Aragorn, tRNAfinder)を併用し、 予測結果が一致しない場合には、エキスパートによる精査を行った。
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trnadb_ce.zip
(22.7 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/trnadb_ce |
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458,123件 |
データ詳細
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| Protein | Trypanosomes Database | 10.18908/lsdba.nbdc01243-001 |
タンパク質の情報(配列情報、機能情報、関連する代謝系の情報)をまとめた一覧です。タンパク質の候補阻害剤がある場合は、その化学物質の情報も得られます。 |
trypanosome.zip
(1.4 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/trypanosome |
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17 件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |
データのメタデータ一覧