サンプルアノテーション情報

データ名

サンプルアノテーション情報

DOI

データ内容の説明

各プロジェクトが提供しているサンプルアノテーション情報。
CAGEデータとGeneChipデータとで項目が異なる。

データファイル

データファイル名:

refex_sample_ann01_cage_human_prjdb1099

データのURL:

ファイルサイズ:

27 KB

データファイル名:

refex_sample_ann02_cage_mouse_prjdb1100

データのURL:

ファイルサイズ:

11 KB

データファイル名:

refex_sample_ann03_genechip_mouse_gse10246

データのURL:

ファイルサイズ:

3 KB

データファイル名:

refex_sample_ann04_genechip_rat_gse952

データのURL:

ファイルサイズ:

2 KB

簡易検索URL

データ取得方法

各プロジェクトから取得

解析方法

データ件数

項目名	項目の説明
CAGEによるデータ
FANTOM5 Original Order	FANTOM5における順序
Alphabetical Uniq Order by developmental, primary cells	アルファベット順による順序
RefEx Tissue Class10	組織を10分類したときの各組織のID
RefEx Tissue Class40	組織を40分類したときの各組織のID
Cell Class	細胞の実験的性質に関する分類
Tissue Class	組織の実験的性質に関する分類
Description (RefEx refined)	RefExでのサンプルの補足情報
FANTOM5 URL	FANTOM5のサンプル情報ページへのURL
Description (FANTOM5)	FANTOM5でのサンプルの補足情報
GeneChipによるデータ
Accession	サンプルのGEO accesson
Title	サンプルの名称
Sample Type	サンプルの種別
Taxonomy	生物種名
Channels	マイクロアレイで用いた蛍光色素の種類数
Platform	実験プラットフォームのGEO accession
Series	サンプルの属するシリーズのGEO accession
Supplementary Types	入手可能な生データのファイル形式
Supplementary Links	生データファイルへのURL
SRA Accession	SRA accession
Contact	データについての連絡先
Release Date	データの公開日

このデータベースについて