データベース全般 | |
 名称 | AcEST |
| 名称の読み方 | アセスト |
| 別名 | Adiantum capillus-veneris EST |
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00839-000 |
| 作成者 | |
| 連絡先 | 〒192-0397 |
| データベース分類 | 塩基配列データベース 植物データベース-その他の植物 |
| 生物種 | |
| データベースの説明 | 首都大学東京で決定したホウライシダのESTシーケンスと、それらのシーケンスとUniProtKB/Swiss-Prot、TrEMBLデータベースと の間で行ったblastx検索の結果をデータベース化したものである。これまで、様々な植物ゲノム解析が進められているが、陸上植物(種子、シダ、コケ植物)の中でシダ植物のゲノムに関する研究は発展していない。そこで光形態形成に関する研究に用いられてきたホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)をシダのモデル植物として位置づけるために、 EST配列の解析を行った。 |
| データベースの特長・有用性・活用方法 | AcESTはホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)のEST配列データ約3万件に二次情報を追加したデータベースである。シダ植物の新規遺伝子を探索するために活用することが可能であり、遺伝子の進化の解明やシダ植物特異的な遺伝子情報の収集をすることが出来る。 |
| データベースの利用許諾 | CC 表示-継承 詳細 |
| 予算的背景・プロジェクト | |
| 論文等 | |
データベースのオリジナルサイト情報 | |
| データベース運用場所 | |
| オリジナルサイト | http://togodb.dbcls.jp/acest/ |
| 運用開始年月日 | 2009/6/12 |
| 最終更新年月日 | 2009/11 |
| 統括サイト | - |
| データの一括ダウンロードサイト | http://togodb.dbcls.jp/acest/ |
| 参照先データベース | - |
| 一覧表示 | 有り |
| クエリ検索 | 有り |
| Webサービス | 無し |
| WebサービスURL | - |
| ユーザ登録 | 無し |
